 | Termonucleotideblast.ThermonucleotideBlast é um aplicativo para pesquisar um banco de dados de destino de sequências de ácido nucleico. |
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Termonucleotideblast. Classificação e resumo
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- Licença:
- GPL
- Preço:
- FREE
- Nome do editor:
- Jason D. Gans
- Site do editor:
- http://public.lanl.gov/jgans/tntblast/
Termonucleotideblast. Tag
Termonucleotideblast. Descrição
O termonucleotideblast é um aplicativo para pesquisar um banco de dados de destino de sequências de ácido nucleico. A ThermonucleotideBlast é uma aplicação para procurar um banco de dados de destino de sequências de ácido nucleico usando uma consulta específica de ensaio baseada em ensaios bioquímicos (ou seja, um par de sequências oligonucleotídicas representando primers de PCR ou sondas de cadeado, um triplo de oligos representando primers de PCR e uma sonda de PCR, ou um único oligo representando uma sonda de hibridação). Acompõe programas existentes como a explosão, que usam medidas heurísticas de similaridade de sequência para identificar correspondências entre uma consulta e sequência alvo, o termonucleotideblast usa energia livre e temperatura de fusão. O que é novo nesta versão: Apresenta uma reescrita significativa do algoritmo de alinhamento termodinâmico, incluindo a adição do algoritmo de programação fracionária da Dinkelbach para computação de temperaturas de fusão duplex.
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