Pdbcat. pdbcat manipula arquivos de molécula PDB com ferramentas baseadas em texto, como Perl, AWK, etc.
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Pdbcat. Classificação e resumo

Pdbcat. Tag

pdb. moléculas Manipulador de molécula Pdbcat.

Pdbcat. Descrição

PDBCAT Ele manipula arquivos de molécula PDB com ferramentas baseadas em texto, como Perl, Awk, etc. O PDBCAT pode ser usado para manipular e processar arquivos PDB usando ferramentas comumente disponíveis, como Perl, AWK, etc.written por Andrew Dalke do grupo biofísico teórico, Instituto Beckman, Universidade de Illinois. Nenhum de nós é responsável por quaisquer erros, erros ou equívocos. Você pode usar este programa livremente e gratuito para uso não comercial. Você pode redistribuir e modificar o código, desde que eu tenha dado crédito pela minha parte do trabalho.Installation1) Descompacte e descontar a fonte% cat pdbcat_1.tar.z | Descompactar | Tar -XF -2) Altere para o diretório PDBCAT e execute a% CD PDBCAT; MAKE3) Se reclamar de não encontrar CC, então você terá que editar o Makefile e definir CC igual ao seu compilatório local C ++, por exemplo, para GCC: CC = GCC4) se houver um problema com o StrCASECMP, descomente o seguinte Linha no MakeFile: #def = -dnostrcasecmpupdate o carimbo de hora no arquivo common.c% Touch Common.cand Run Fazer NOTUSAGEPDBCAT {-Fields | -Columns} Arquivos] Leia qualquer arquivo PDB de stdin ou lista de arquivos e converta os dados para um arquivo PDB baseado em coluna ou baseado em campo. Um '#' representa um campo vazio. Isso é útil para ferramentas baseadas em campo como awk. A saída padrão é 'colunas'.

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