Sistema eletrônico

Um ambiente de modelagem e software de simulação.
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  • Kouichi Takahashi
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Sistema eletrônico Descrição

Um ambiente de software de modelagem e simulação. O sistema de células eletrônicas é um conceito de construção de células virtuais no sistema de células Computers.e é uma suíte de software orientada a objetos para modelagem, simulação e análise de sistemas complexos de larga escala, como células biológicas, arquitetado por Kouichi Takahashi e escrito por um equipe maravilhosa de desenvolvedores. Parte central do sistema, o ambiente de simulação de e-células versão 3, permite que muitos componentes conduzidos por vários algoritmos com diferentes prazos para o projeto coexistente.E-Cell é um projeto de pesquisa internacional visando desenvolver necessários suportes teóricos, tecnologias e plataformas de software para permitir Simulação de células inteiras.E-Sistema consiste nas seguintes três partes principais: - Ambiente de simulação de células eletrônicas (ou e-Cell SE) - Ambiente de modelagem de células E (ou E-Cell Me) - Análise de E-Cell Analysis aqui são Algumas características importantes do "sistema eletrônico": Capacidades Básicas: · Modelagem orientada a objetos e simulação de sistemas complexos. · Arquitetura de plug-in. Novas classes de objeto de usuário podem ser desenvolvidas, carregadas dinamicamente e usadas na simulação. · Interação e visualização do usuário em tempo real durante a simulação. Scripting: · Script python de uma sessão de simulação (execução / parada / parâmetro Manipulação / processamento de dados etc ...). · Script Python de um experimento de simulação que envolve muitas corridas das sessões de simulação (como ajuste de parâmetros, análise de controle metabólico etc.) · Python Scripting da Geração de Arquivos Model (por exemplo, para construção de modelo automatizado de bancos de dados). Compatibilidades: · Nível de SBML 1/2 Importando. · Nível SBML 1/2 Exportando. Computação Paralela: · Memória compartilhada, paralelização multi-thread de uma única sessão de simulação. (para ser fundido no ramo principal.) · Cluster e grade distribuídos computação de múltiplas sessões de simulação. Motor de grade de sol (Globus Toolkit). O que há de novo nesta versão: · Corrigido um bug no ecell.Session.saveloggerdata (). (Moriyoshi) · Corrigido um bug no ecell.ecdDataFile. (Moriyoshi)


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