| Junção rápida QuickJoin implementa uma heurística para acelerar a junção do vizinho, fazendo o vizinho se unindo a vários conjuntos de táxons. |
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Junção rápida Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Thomas Mailund
- Site do editor:
- http://www.daimi.au.dk/~mailund/qdist.html
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Junção rápida Descrição
QuickJoin implementa uma heurística por acelerar a junção do vizinho, fazendo o vizinho se juntando a vários conjuntos de táxons. O projeto QuickJoin implementa uma heurística para acelerar a junção do vizinho, fazendo vizinho se juntando a vários conjuntos de táxons. A árvore inferida é idêntica à árvore inferida pelo método tradicional de junção vizinho, mas a heurística vai (potencialmente) construir a árvore significativamente mais rápida.Uma: O programa QuickJoin, qjoin lê uma matriz de distância no formato de Phylip ou stdin, e produza a árvore inferida, em formato newick, para um arquivo ou stdout. Executar 'qjoin --help' para mais informações.Instalação: do pacote SourceThe QuickJoin é escrito em C ++. Deve compilar em qualquer sistema do Unix Like. Para instalar o pacote, faça o download do código-fonte e descompacte-o (TAR XZF Rápido-junção-ABCTAR.GZ, onde ABC é o número da versão do Quick-Inscrend) e, em seguida, execute Configurar e fazer no subdiretório. durante a desembalagem. Isso cria o programa QuickJoin, qjoin junto com vários programas de teste. Para verificar se tudo foi direto, execute o cheque. Se todos os testes passarem, instale o programa Qjoin, executando a instalação. Leia o arquivo de instalação para mais informações. De BinaryCurrently, a única distribuição binária é em pacotes RPM. Outros formatos podem aparecer, se for solicitado a construí-los (e contasse como ...). Para instalar, baixe o arquivo e execute RPM -U Quick-Live-boin-version.arch.rpm.what novo nesta versão: · Esta versão divide a saída, ao fazer bootstrapping, em duas árvores, um anotado com comprimentos de ramificação e um anotado Com valores de bootstrap. · Isso facilita a pós-processamento, já que a maioria das ferramentas suporta uma única anotação de ramificação, mas não duas.
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