ESTSCAN. Detecte as regiões de codificação em sequências de DNA, mesmo que sejam de baixa qualidade
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ESTSCAN. Classificação e resumo

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ESTSCAN. Descrição

Detectar regiões de codificação em sequências de DNA, mesmo que sejam de baixa qualidade O Projeto Estscan é um programa que pode detectar regiões de codificação em seqüências de DNA, mesmo que seja de baixa qualidade. O EstScan também detectará e corrigirá erros de sequenciamento que levam a Frameshifts.estScan não é um programa de previsão genético, nem é um detector de quadros de leitura aberta. De fato, sua força está no fato de que não requer um quadro de leitura aberto para detectar uma região de codificação. Como resultado, o programa pode perder alguns aminoácidos traduzidos no terminal N ou no C, mas detectará regiões de codificação com alta seletividade e sensibilidade.MethodestScan tira vantagens do viés no uso de hexanucleótidos encontrados em regiões de codificação em relação a regiões de codificação. Este viés é formalizado como um modelo de Markov escondido de 3 periódicos inomogênicos (HMM). Além disso, o Hmm do EstScan foi estendido para permitir inserções e exclusões quando estes melhoram as estatísticas da região de codificação. O que há de novo nesta versão: · Adicione algumas verificações de sanidade no programa MakeMat, de modo que não falha na entrada incorreta e fornece mensagens de erro potencialmente úteis

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