CLC Main Workbench Um ambiente de software que permite aos usuários fazer um grande número de sequência de proteína avançada analisar
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CLC Main Workbench Classificação e resumo

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CLC Main Workbench Descrição

Um ambiente de software que permite aos usuários fazer um grande número de sequência de proteína avançada analisar O CLC Main Workbench cria um ambiente de software, permitindo que os usuários façam um grande número de análises avançadas de seqüência de proteína, combinadas com gerenciamento de dados suaves e excelentes opções de visualização gráfica e opções de saída.Clc, a principal bancada principal está disponível na plataforma Linux, Mac OS X e Windows. Aqui estão algumas características principais da "CLC Main Workbench": Gerenciamento de projetos e dados: · Integração total da entrada de dados, gerenciamento de dados, resultados de cálculo e exportação de dados · Log de histórico detalhado · Todos os tipos de arquivos podem ser salvos em projetos locais e lançado do programa · Importar e exportar dados em um grande número de formatos de arquivo · Opção de trabalhar em vários espaços de trabalho ativos de cada vez, permitindo o trabalho simultâneo em vários projetos · Importar arquivos de dados de rastreamento e pontuações de qualidade de máquinas de sequelamento automatizadas de DNA usando formato padrão de cromatograma, formatos ABI e formato de doutorado (Phred) Recursos de Bioinformatics em Protein Workbench: · Alfa-hélices e beta-folhas mostradas como anotações na sequência. · Vista da molécula 3D · Previsão de hélice Transmembrame · Antigenicidade · Previsão de estrutura de proteína secundária · Pesquisa de domínio PFAM · Predição baseada na Web de peptídeos de sinal e seus locais de clivagem (sinalp - a melhor ferramenta disponível) · Análises e gráficos de hidrofobicidade · Análise de carga de proteína e gráficos · Tradução reversa da proteína para o gene (uma série de tabelas de tradução) · Traduções interativas de DNA e RNA para proteína (ambas as seqüências únicas e alinhamentos) · Detecção de clivagem proteolítica · Relatório de estatísticas de proteína (uma ou mais proteínas em cada relatório) · Relatório abrangente, incluindo uma variedade de análises de proteínas em um documento · Pesquisas integradas da Uniprot (Swiss-Prot / Trembl) · Pesquisa baseada na Web de dados de sequência nos bancos de dados Uniprot e NCBI, bem como o Google Recursos de Bioinformatics em Gene Workbench: · Visualização flexível de moléculas circulares. · Editor para design de primer graficamente e algoritmicamente avançados · Montagem de dados de sequência de DNA · Clonagem molecular · Anotação automática do SNP de seqüências · Pesquisar e descoberta de padrões de DNA · Análises da região da complexidade local · Tradução reversa da proteína para gene, com base nas tabelas de tradução de uma série de espécies · Análise e gerenciamento de enzimas de restrição avançada · Análises baseadas em plotagem de pontos · Estatísticas de DNA de forma curta, incluindo uma série de características de uma determinada molécula · Pesquisa de dados de seqüência NCBI · Acesso a informações da Web do PubMed Outros recursos de bioinformática: · Editor de sequência de DNA, RNA e proteína exibindo moléculas lineares e circulares · DNA, RNA e editor de alinhamento de proteína · Logos interativos ao longo dos alinhamentos de DNA, RNA e proteína · Processamento em lote de análises em várias seqüências em um passo de trabalho · Motivo de pesquisa · Descoberta padrão (padrões desconhecidos) · Opção avançada de alinhamento de re-alinhamento e ponto de fixação · Gráficos de logotipo de sequência ao longo de alinhamentos de DNA, RNA e proteína · Anotação manual de seqüências · Pesquisas Integradas do Pubmed · Pesquisa de seqüência baseada na Web usando a explosão · Análises baseadas em plotagem de pontos · Análises de região de complexidade local e parcelas de complexidade · Gráficos de fração GAP · Análise de conteúdo g / c e gráficos Visualizando e reportando: · Vista avançada de explosão · Visualização de gráficos avançados · Vista avançada do histograma · Vista avançada do enredo do ponto · Pesquisar por características em seqüências e alinhamentos Requisitos: · RAM de 256 MB necessária · 512 MB de RAM recomendado · 1024 x 768 Exibição recomendada Limitações: · Demo totalmente funcional de 4 semanas

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