Anotatão Treinamento BioInformatics através da anotação de seqüência metagenômica.
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curso Treinamento bioinformática. bioinformática curso Treinamento Bioinformatics.

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formação bioinformática através de anotação seqüência metagenomic. Annotathon é um ambiente de ensino Internet para estudantes universitários que seguir bioinformática básicos curso. Um servidor online implementação do Annotathon está disponível em: http://annotathon.univ-mrs.fr/We aproveitaram a quantidade crescente de dados metagenômica publicamente disponível para desenvolver um ambiente de ensino em que estudantes de graduação têm a oportunidade de transformar dados em conhecimento. Chamado Annotathon, este ensinamento internet trabalho em equipe promove plataforma e guias aprendiz anotadores através de cada passo em análises in silico, desde a identificação ORF com a classificação funcional e filogenética. Gerando resultados brutos é uma parte integrante do exercício, mas forte ênfase é colocada em sua interpretação e formato online crítica assessment.The é ideal para a classe fora envolvimento dos alunos, permitindo simultaneamente instrutores para fornecer anotadores com feedback contínuo. Um ciclo de avaliação iterativa permite que os alunos respondem a críticas construtivas e produzir versões melhoradas de suas anotações. A saída do estudante pesquisa mostra que, embora um desafio, o estudo de como ainda sequências não-anotadas é um grande incentivo para 75% dos participantes. O sucesso desta abordagem baseia-se no seguinte: i) Aprender fazendo: bioinformática é melhor introduzidas pela experiência em primeira mão; considerações teóricas são mais fáceis de compreender uma vez realmente familiarizado com o tools.ii) Aprender pela repetição: sucessivamente analisar várias sequências dá aos alunos a oportunidade de experimentar uma grande variedade de situações, por exemplo, Zona de penumbra semelhanças, ou garbage in, garbage out reconstructions.iii árvore filogenética) Aprender com críticas construtivas: dando aos estudantes a oportunidade de corrigir-se resulta em progressão notável sobre time.502 de estudantes participaram no Annotathon ao longo da última três anos, a análise de um total de 2,3 Mb de ADN microbiano para o mar, o que representa 9.500 horas de anotação cumulativa. Curiosamente, mão estudante trabalhada anotações estão em muito estreita concordância com os obtidos por pipelines de anotação automáticas. Com base nestas observações, chamamos nossos colegas a considerar juntar uma iniciativa para criar uma grade de anotadores de graduação em todo o mundo. Timidamente, como mais equipes participar, isso poderia levar a uma comunidade anotação educativa com espaço para contribuição científica. O ambiente Annotathon on-line open source (http://annotathon.univ-mrs.fr) é oferecido como base para esta iniciativa colaborativa. Requisitos: · PHP. · MySQL.

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