| msplicer. Ferramenta para melhorar a anotação do Genoma C. Elegans usando a aprendizagem de máquina |
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msplicer. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Friedrich Miescher Laboratory
- Site do editor:
- http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 18 KB
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msplicer. Descrição
Ferramenta para melhorar a anotação do genoma C. elegans usando aprendizagem de máquina Treinar a ferramenta MSPLICER envolverá a solução de um problema de otimização linear relativamente grande, implementado no Matlab usando o pacote de otimização do CPLEX. O MSPLICER é baseado em scripts Python que chamam métodos implementados em C ++ para prever sites de splice usando máquinas de vetor de suporte e programação dinâmica para a previsão de formato de emenda. Essas rotinas fazem parte da caixa de ferramentas Shogun disponíveis gratuitamente para o aprendizado do kernel de grande escala. Requisitos: · Shogun 0.6.2 ou mais tarde · Pitão
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