msplicer.

Ferramenta para melhorar a anotação do Genoma C. Elegans usando a aprendizagem de máquina
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msplicer. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • Friedrich Miescher Laboratory
  • Site do editor:
  • http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
  • Tamanho do arquivo:
  • 18 KB

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msplicer. Descrição

Ferramenta para melhorar a anotação do genoma C. elegans usando aprendizagem de máquina Treinar a ferramenta MSPLICER envolverá a solução de um problema de otimização linear relativamente grande, implementado no Matlab usando o pacote de otimização do CPLEX. O MSPLICER é baseado em scripts Python que chamam métodos implementados em C ++ para prever sites de splice usando máquinas de vetor de suporte e programação dinâmica para a previsão de formato de emenda. Essas rotinas fazem parte da caixa de ferramentas Shogun disponíveis gratuitamente para o aprendizado do kernel de grande escala. Requisitos: · Shogun 0.6.2 ou mais tarde · Pitão


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