| Tandemizador Ferramenta de código aberto e livre que permite visualizar o arranjo integral do genoma |
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Tandemizador Classificação e resumo
- Site do editor:
- http://www.tgen.org/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 5.7 MB
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Tandemizador Descrição
Ferramenta de código livre gratuita e aberta que permite visualizar o arranjo integral do genoma O Tandemizer, que usa a saída do programa Mummer Suite "Exact-tandems", combinado com sequências inteiras genômicas e arquivos opcionais do Genbank, para comparar graficamente as guias entre dois ou mais genomas inteiramente prokaryóticos. A Dandemizer é uma ferramenta extensível e flexível que permite visualização de Arranjo integral entre muitos genomas baseados em guias, com correlações com anotações genbank para genes e outros recursos, e drill-down para o nível de sequência para a análise do polimorfismo. O tandemizer tem sido usado para procurar correlações com marcadores para a virulência e resistência ao antibiótico, para avaliar visualmente o grau de relacionamento entre os genomas de Staphylococcus, Streptococcus e Francisella, e para avaliar a relação de elemento é licenciado e distribuído sob os termos do Licença acadêmica e de pesquisa. Requisitos: · Java.
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