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 | Palma.mRNA para alinhamentos do genoma usando grandes algoritmos de margem |
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Palma. Classificação e resumo
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- Licença:
- GPL
- Preço:
- FREE
- Nome do editor:
- Friedrich Miescher Laboratory
- Site do editor:
- http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 4.4 MB
Palma. Tag
Palma. Descrição
MRNA para alinhamentos de genoma usando grandes algoritmos de margem Palma alinha duas sequências genômicas de maneira ideal de acordo com seu algoritmo subjacente e parâmetros treinados. O principal script Python leva dois arquivos FASTA contendo o destino (por exemplo, uma seqüência de DNA, parte do genoma) e seqüências de consulta (por exemplo, uma seqüência de cDNA ou EST). Palma cria um alinhamento usando programação dinâmica (escrita em C ++) e retorna o alinhamento em um formato como PSL. Os algoritmos serão os que computarão os alinhamentos locais ideais, por isso, se nenhum alinhamento foi encontrado, é porque nenhum alinhamento tem uma pontuação de alinhamento suficientemente alta. Requisitos: · Shogun · Pitão
Palma. Software Relacionado
