Transposponsi. Transposponsi é uma ferramenta de análise para identificar proteína ou sequência de ácido nucleico homology.
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Transposponsi. Classificação e resumo

Transposponsi. Tag

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Transposponsi. Descrição

A Transposponsi é uma ferramenta de análise para identificar a proteína ou a sequência de ácido nucleico homology. A TransposonPSI é uma ferramenta de análise para identificar proteínas ou sequências de ácido nucleico às proteínas codificadas por diversas famílias de elementos transponíveis. A PSI-BLAST é usada com uma coleção de perfis de homologia ORF (retro-) transposon para identificar alinhamentos estatisticamente significativos. Este método pode ser usado para identificar potenciais orfs transposon dentro de um conjunto de proteínas, ou para identificar regiões de homologia transposon dentro de uma sequência maior de genoma . Isto é particularmente útil para identificar as homologias degenerate transposon dentro de sequências de genoma que escapam de identificação e mascaramento usando o RepingMasker e uma biblioteca nucleotídica associada de elementos repetitivos.Transposponsi foi rotineiramente usado no Instituto de Pesquisa Genômica para ajudar na descoberta de elementos móveis entre os eukartos incluindo protozoários, plantas, fungos e animais. Requisitos: · Explosão NCBI, incluindo Blastall e BlastPGP · Bioperl.

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