Coasim. Coasim é uma ferramenta para simular o processo coalescente com recombinação e conversão genética.
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Coasim. Classificação e resumo

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Coasim. Descrição

Coasim é uma ferramenta para simular o processo coalescente com recombinação e conversão genética. Coasim é uma ferramenta para simular o processo coalescente com recombinação e geneconversion sob vários modelos demográficos.Coasim efetivamente construiu o gráfico de recombinação ancestral para um determinado número de indivíduos e usula isso para simular amostras de SNP, micro-satélite e outros haplótipos / genótipos. A amostra gerada pode posteriormente ser separada em casos e controles, dependendo dos estados de marcadores individuais selecionados. A ferramenta também pode ser usada para construir casos e conjuntos de dados de controle para estudos de associação.Coasim é desenvolvido em colaboração entre Bioinformatics APS e Bioinformatics Research Center (BIRC) .Coasim é escrito em C ++ e Scheme Guile e está disponível como código fonte (sob A Licença Pública Geral GNU, GPL) e como versões binárias como arquivos Linux RPM. O código-fonte foi compilado com sucesso em vários sistemas Linux e UNIX, sob o OS X e no Windows com Cygwin.as, eu tenho apenas acesso limitado a arquiteturas que não o Linux, não é possível para mim fazer distribuições binárias para outras plataformas, mas Se alguém estiver disposto a construir as distribuições, ficarei mais do que feliz em colocá-los neste site. O que é novo neste lançamento: · Callbacks para eventos de estrutura populacional (gargalos, migração, etc.) foram adicionados. · Um grande erro que Causou os tempos de partida e final de épocas para estar errado em alguns casos (começando tarde demais ou nunca terminando) foi corrigido.

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