Associação de marcadores únicos Single Marker Association é uma ferramenta simples que calcula a única associação de marcadores entre marcadores individuais do SNP.
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Associação de marcadores únicos Classificação e resumo

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Marcador Associação SNP Associação de marcadores Marcadores SNP. Dicotomia de controle

Associação de marcadores únicos Descrição

A única associação de marcadores é uma ferramenta simples que calcula a única associação de marcadores entre marcadores SNP individuais. A única associação de marcadores é uma ferramenta simples que calcula a única associação de marcadores entre marcadores SNP individuais e uma dicotomia de caso / controle.Usage: A ferramenta lê dois arquivos como entrada, o primeiro é um conjunto de caso e o segundo caso de haplotipos de controle. O formato dos arquivos é uma linha por HaPlotype, onde os dados SNP são representados como 0 ou 1, separados por espaço branco. · A ferramenta produz uma lista de estatísticas para cada marcador · o número do marcador (da esquerda para a direita nos dados de entrada) · A frequência do alelo 0 para o arquivo de casos · As estatísticas da tabela de contingência do qui-quadrado para o marcador · o CDF Das estatísticas do qui-quadrado · O valor p da instalação de estatísticas (1-CDF): A ferramenta SMA é escrita em C ++. Deve compilar em qualquer sistema do Unix Like. Para instalar, baixe o código-fonte e descompacte-o (tar xzf sma-v.tar.gz, onde v é o número da versão de SMA), então execute make no subdiretório sma-v criado durante a desembalagem. O que é novo nesta versão: · Suporte para dados de genótipo (unfased).

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