Greylag. Software para identificação de peptídeo de espectro de massa em tandem
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Greylag. Descrição

Software para identificação de peptídeos de espectro de massa em tandem Software de identificação e validação de péptido espectral de massa tandem, semelhante ao X! Tandem, OMSSA, mirimatch. O Greylag é adequado para hosts únicos através de clusters grandes.Greylag é escrito em Python para simplicidade, com seções críticas de desempenho em C ++. Requisitos: · Pitão O que há de novo nesta versão: · Novo programa `` Greylag-ReanNotate`` Leva um conjunto de arquivos sqt e um fasta · Banco de dados e reannata os peptídeos encontrados como se a pesquisa tivesse sido feita · Contra o banco de dados especificado. (Isso geralmente é muito mais rápido que refazer · a pesquisa.) · Este comando funcionará em arquivos sqt produzidos por Greylag ou Sequest e · Corrige alguns problemas de truncamento em loci gerados por este último. Isso também · Produz melhor resíduos de flanqueamento e alças resíduos isobáricos mais · Corretamente. · `` Greylag-Validar - Preferer-Mass Mass` »agora tem melhor alias de carga · manipulação. · `` Maximum_missed_cleavage_sites`` », agora padroniza para 1. · Carros Caracteres de retorno em arquivos MS2 agora são tratados melhor.

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