Pipedal Pipedal é um módulo Python que fornece ferramentas para a manipulação de pedigrees.
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Pitão Módulo Python. manipulação de pedigrees. visualização de pedigrees Pedal pedigrees.

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Pipedal é um módulo Python que fornece ferramentas para a manipulação de pedigrees. O Projeto Pypedal é um módulo Python que fornece ferramentas para a manipulação de pedigrees, visualização simples de pedigrees, e o cálculo de medidas de diversidade genética de pedigrees.O que é novo nesta versão: · Adicionado pipedalError e pipedaledigreenPilenameError classes. Agora, a exceção levantada em newpedigree :: __ init __ () realmente funciona de forma correta.did mais algum trabalho em PYP_Newslasses / newanimal :: __ init __ () Para garantir que os métodos de string não sejam chamados de não-strings.pyPyNewClasses / newanimal :: string_to_int () agora usa um novo algoritmo de hash tirado de "Chaves de cadeia de caracteres" em "estruturas de dados e algoritmos com padrões de design orientados a objetos no Python" por Bruno R. PreSS: http://www.brpreiss.com/books/opus7 /html/page220.html#progstrnga.Esta corrige o problema de colisão com o algoritmo anterior (mas qualquer algoritmo que produz, digamos, inteiros de 32 bits colidirão sob as circunstâncias certas) .ok, o problema com PYP_UTILS / Reorder () tem Foi identificado: Abordagem de hash Pelag usada em PYP_Newses / newanimal :: string_to_int () está colidindo. Por exemplo, os strings 'anjhl5876dc' e 'onnll5876dc' e 'onnldf348rc' hash para o mesmo valor.Made uma mudança para PYP_Newsclasses / newanimal :: __ init __ () para que os nomes animais, senhores e barragens estejam corretamente atribuídos mesmo se os IDs integrados sejam aprovados Strings.pyP_Newslasses / newpedigree :: Pré-processado () não lança mais animais, senhores e ids de barragens em seqüências de seqüências ao adicionar entradas de pedigree para perder pares e barragens. O elenco estava quebrando o código de atribuição do fundador em PYP_NEWCLASSES / Newanimal :: __ init __ (). Desligado um monte de mensagens de depuração deixadas no pyp_utils / reorder (). Pyp_utils / ceder_offspring () foi bastante completamente quebrado devido a erros introduzidos quando o novo Conversão do modelo de objeto foi feita. O que é novo nesta versão: 06/26/2007 Mais bugfixes para PYP_UTILS / Reordenar (). Os dicionários do TheOrderDict e OrderBackDict são agora corretos quando um animal no pedigree é movido. Esses casos fixos em que o pedigree não foi corretamente reordenado. Quando isso aconteceu, PYP_UTILS / Renumber () pegou keyErrores enquanto procurava por senhores / barragens e definir os pais para desconhecidos, ignorando relacionamentos conhecidos no pedigree. Os relatórios persistentes de George Wiggans que as relações que estão sendo calculadas eram simplesmente conduzidas à causa da causa do problema. Obrigado, George! 06/25/2007 removido pyp_utils / reorder_list (). 06/21/2007 pyp_utils / reordenar () agora gravará mensagens de erro para o logfile e o stdio se um pedigree não puder ser renumerado em Renumber_Max_Rounds de iteração. 06/21/2007 Adicionado novo parâmetro, max_rounds, para pyp_utils / reordenar (). PYP_Newsclasses / newpedigree Passes renumer_max_rounds para reordenar, mas as rotinas em PYP_NRM / * do OT.06 / 21/2007 adicionam nova opção, renumerar_max_rounds, para PYP_NewClasses / newpedigree :: __ init __ (). O valor padrão é 100 Rounds.06 / 21/2007 completamente reescreveu PYP_UTILS / Reorder (), que tem sido a faixa de minhas existências e fonte da maioria dos bugs pipedal por um longo tempo agora.06 / 21/2007 Bug fixo em PYP_NRM / endogamia () para que ele funcione corretamente com NRM.06 / 20- / 2007 pré-calculado adicionado uma nova função, PYP_IO / WRITE_IJK (), que salva um NRM para um disco no formato IJK, onde eu e J são IDs de animais e k é (1. + o coeficiente de endogamia) quando (i == j) ou coeficiente de relacionamento quando (i! = j) .06 / 20/2007 Reescrete uma mensagem de erro no PYP_Newses / newpedigree :: preprocess () assim que agora faz sentido.

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