neuroconstruct 3D modelagem de rede neural biofísica detalhada
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neuroconstruct Classificação e resumo

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rede neural rede neurônio Neurociência computacional

neuroconstruct Descrição

O neuroconstruct é um aplicativo confiável criado para simplificar o desenvolvimento de redes complexas de neurônios biologicamente realistas, isto é, modelos incorporando morfologias dendríticas e condutas de membrana celular realistas. Ele é implementado em Java e gera arquivos de script para os simuladores de neurônios e gênese, com suporte para outras plataformas de simulação (incluindo PSICs, Moose e Pynn) em estágios avançados de desenvolvimento. Ele usa as mais recentes especificações do Neuroml, incluindo Morphml, Channelml e NetworkML. O desenvolvimento deste software foi possível com financiamento do Wellcome Trust, o Conselho de Pesquisa Médica e o Projeto Sinapse da UE. Principais características: Neuroconstruct pode importar arquivos morfológicos em gênese, neurônio, neurolucida, swc e formato morphml para inclusão em modelos de células ou redes, ou mais células abstratas também podem ser construídas manualmente. Criação de redes de neurônios baseados em condutância posicionados em 3D padrões de conectividade complexos entre os grupos de células podem ser especificados para as redes Scripts de simulação podem ser gerados para simuladores de neurônicos, gênese, alces, psicos e Pynn (Nota: nem todo projeto pode ser gerado para todos os simuladores) Mecanismos celulares biofísicos (sinapses / mecanismos de canal) podem ser importados de arquivos de script nativos (* .mod ou * .g) ou criados a partir de modelos usando Channelml Geração automática de código para gravar dados de simulação e visualização / análise de dados em neuroconstruct As execuções de simulação gravadas podem ser visualizadas e gerenciadas através da interface do navegador de simulação Uma interface de script baseada em Python pode ser usada para controlar a geração e execução do modelo, permitindo que várias simulações sejam executadas para otimização de modelo de células e de rede

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