msatcommander. Este aplicativo de código aberto irá ajudá-lo a localizar repetições de microssatélites, projetar iniciadores específicos de locus e marque-os
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Este aplicativo de código aberto irá ajudá-lo a localizar repetições de microssatélites, projetar primers específicos de locus e marque-os O MSATCommander é um programa Python escrito para localizar microssatélite (SSR, VNTR, C) repete dentro de seqüência formatada por FASTA ou arquivos de consenso formatados. MSATFinder irá procurar por todas as repetições di-, tri-, tetra, penta e hexa-nucleotídeo (com opções para procurar menos tipos de repetição e combinações de tipos de repetição) .msatCommander também vai marcar e projetar primers usando o Primer3 como seu primer motor de design. Aqui estão algumas características principais de "Msatcommander": · Pesquisas por toda mono, diária, tetra, penta e hexanucleótidos · As repetições podem ser combinadas entre as distâncias especificadas pelo usuário (BP) · Projetos primers para repetições localizadas · Tags e testes primers com M13R, CAG ou Tag Personalizada. O 'melhor' primer é reportado ao usuário · Oferece uma conveniente GUI para a maioria dos usuários · As saídas resulta no formato CSV, para facilitar a importação para o software da planilha

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