Oligofaktory se.

oligofaktoryse - design oligonucleotídeo feito simples
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Oligofaktory se. Classificação e resumo

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  • Freeware
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • Colas Schretter
  • Site do editor:
  • http://homepages.ulb.ac.be/~cschrett/oligofaktory/
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X 10.4 or later
  • Tamanho do arquivo:
  • 1.2 MB

Oligofaktory se. Tag


Oligofaktory se. Descrição

Oligofaktoryse - design oligonucleotídeo feito simples Oligofaktory Stanalone Edition é uma suíte integrada de ferramentas de bioinformática para o desenho de oligonucleótido longo para micro-array, de par de primer para PCR, de Sirna e muito mais. A interface do usuário enfatiza a usabilidade e destina-se a ajudar os pesquisadores para um design indolor, rápido, automatizado e confiável. A interface master-detalhe permite que os usuários inserem suas seqüências e regiões relacionadas. Os usuários podem reduzir-se e colar o DNA da consulta na visualização do editor, ou podem usar o item de menu de arquivo> Importar para importar arquivos FASTA.Several Design de verificação podem ser aplicados, usando cinco ações complementares: · A ação de design oligos permite que o design automatizado Projeto de oligonucleótidos longos específicos sobre um número arbitrário de Orfs (por exemplo, para o desenvolvimento de microarrays de DNA). · A ação de primers de design permite o design automatizado de pares de primer específicos de PCR em um número arbitrário de regiões. · A ação do design Sirnas permite Projetando o Itimble 19BP Sirna com o método descrito no design racional de Sirna para interferência de RNA, A. Reynolds et al. Nature Biotecnologia, 2004, Vol 22, 326-330. · A ação de detecção de repetições identifica todas as repetições e microsselites sob restrições especificadas pelo usuário. · A ação das regiões de mesclagem incorpora as regiões que estão muito próximas de permitir a concepção de pares de primer específicos. Se necessário, pode escolher uma espécie contra qual sensibilidade e especificidade de oligonucleótidos será avaliada. · Você será capaz de visualizar seus resultados em três sabores diferentes: · A visualização Hierarquia é uma longa listagem que mostra localização relativa Bargraphs de consultas e resultados. · A vista da lista é uma pequena listagem que enfatiza os resultados da folha, enquanto oculta as informações de localizações. · A visualização estatística resume os resultados com gráficos mostrando as distribuições dos principais recursos. Todas as informações detalhadas sobre heterodímero, pino de cabelo, sensibilidade, homodímero e especificidade são obtidas clicando no sequência oligonucleótida.Você pode exportar resultados para FASTA ou um arquivo delimitado por vírgula (CSV), legível pela maioria dos programas de planilha, tal s Microsoft Excel. Você também pode exportar a visualização atual para um arquivo web compatível com o Safari. O que há de novo nesta versão: · A aparência da interface do usuário e os comportamentos de desfazer / refazer são melhorados.


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