Vmtk.

programa que pode ser usado para a reconstrução 3D de vasos sanguíneos
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Vmtk. Classificação e resumo

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  • Vascular Modeling Toolkit Team
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Vmtk. Descrição

Programa que pode ser usado para a reconstrução 3D de vasos sanguíneos O VMTK é composto de bibliotecas e ferramentas para reconstrução 3D, análise geométrica, geração de malha e análise de dados de superfície na modelagem de vasos sanguíneos à base de imagem. Aqui estão algumas características principais de "VMTK": Segmentação de segmentos vasculares (ou outras estruturas anatômicas) de imagens médicas: · Nível 3D baseado em gradientes definir a segmentação. Uma nova modalidade de computação gradiente baseada em diferenças finitas do UPWIND permite a segmentação de embarcações pequenas (abaixo de 1,2 pixels / diâmetro). · Conjuntos de nível interativo com base no método de marcha rápida. Isso inclui um novo método para selecionar um segmento vascular compreendido entre dois pontos, ignorando automaticamente os ramos laterais, sem parâmetros envolvidos. Segmentando um trato vascular complexo desce para selecionar os pontos de extremidade de um ramo, deixando os conjuntos de nível atraídos por picos gradientes com o único termo de advecção ligado, repetindo a operação para todos os ramos e mesclar tudo em um único modelo. Análise geométrica e processamento de dados superficiais de modelos 3D de vasos sanguíneos (e objetos tubulares em geral) ((os principais algoritmos foram publicados em revistas de imagens médicas. Você pode encontrar uma referência completa às publicações nas principais publicações de David Steinman e Luca Antiga)): · Calines de computação e raio de esfera maximal inscrito de estruturas tubulares ramificadas, dada a sua representação de superfície poligonal · Modelos de superfície divididos em seus ramos constitutivos com base na geometria central · Computar quantidades geométricas baseadas na linha central (como ângulos de bifurcação, planaridade, simetria, curvatura de ramificação, tortuosidade) e quantidades geométricas à base de superfície (como distância para as linhas de centro, curvatura de superfície, desvio da tangência para as esferas máximas inscritas) · Rubos de mapas robustamente para um espaço paramétrico retangular · Gerar manchas retangulares com base no mapeamento paramétrico para análise estatística de dados geométricos e CFD sobre as populações. Scripts, ferramentas de E / S e algoritmos simples para trabalhar facilmente com imagens e malhas: · Leia e escreva uma série de formatos de malha de imagem, superfície e volume. Inclui um leitor da série DICOM com recursos de lançamento automático, Reader de formato de malha Netgen, escritor de formato de malha do libmesh XDA, wrapper do gerador de malha Tetgen, Reader FDNeut Format Format Format Format e um gerador de arquivos de entrada NewTetr. · Exibir imagens e malhas · Incapsular várias classes VTK e disponibilizá-las como scripts pipeable e. Cubos de marcha, suavização de superfície, recorte, computação normal, (conectividade, subdivisão, distância entre as superfícies, o registro do ICP) · Adicionar extensões cilíndricas aos limites do modelo de superfície como uma etapa de pré-processamento para simulações CFD. · Gerar camadas de limite de elementos prismáticos com espessura variável para CFD O que há de novo nesta versão: · Bug fixo na geração de extensão de fluxo · Melhor enfrentamento de superfície · Problemas fixos de compilação do Windows · Corrigido problemas de compilação de 64 bits · Finalmente (graças à grande contribuição inicial da Michalis e da ajuda posterior por Hugo e Joppe), a exportação fluente para arquivos MSH funciona corretamente e preserva os indicadores de limite corretamente. Isso também permite usar malhas VMTK com OpenFoam. · Dolfin e Writers de malha Lifev corrigidos e melhorados · Adicionado interpolação de função radial · Adicionado modelagem eficiente de tubos de centro de centro + raio · Incluiu novos métodos de aprimoramento de embarcações · Algoritmo de análise rápida de rede vascular (veja minha tese de PhD) portado para VMTK · Projeção quadrática de malhas lineares agora faz uma verificação completa para jacóbios negativos · Adicionado classe MPR curvada e script contribuído por Hugo (junto com VMTKimagesHiftCale, VMtksurfacetransforminteractive e melhorias para VMtksurFacetransform e VMTKimageresLice - confira-os!) · Mesclação de linha central adicionada · Adicionado extração de perfis de bifurcação · Adicionado script de tetrahedralização para malhas mistas


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