Xplasma cria mapas de plasmídeo, mostrando recursos como genes, promotores, vários locais de clonagem e enzimas de restrição.
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Cria mapas de plasmídeos, mostrando recursos como genes, promotores, vários locais de clonagem e enzimas de restrição. O XploMap é uma ferramenta que desenha mapas de plasmídeos, mostrando recursos como genes, promotores, vários locais de clonagem e enzimas de restrição. Os mapas são projetados para serem facilmente modificados (por exemplo, para mapear novas inserções em um vetor), e os recursos podem ser personalizados Um número de maneiras.Xplasmap requer macosx. Eu não sei quais versões são necessárias; Eu sei que o Tiger (10.4) funciona, eu tenho certeza que o pantera (10.3) deve funcionar, e versões anteriores também podem funcionar.xplasmap é livre (como sem custo) e pode ser redistribuído como um pacote completo. Não faço garantias ou garantias de qualquer tipo.xplasmap, consegue exibir um backbone de plasmídeo circular com quatro tipos de características: 'múltiplos sites de clonagem' (MCS), 'genes', 'enzimas', mas também informações básicas de plasmídeo, como nome, tamanho e notas. Aqui estão algumas características principais de "Xplasmap": · O backbone do plasmídeo é desenhado como um círculo simples (exemplo). O nome e (opcional) data e criador são mostrados no centro, e os comentários (opcionais) são gravados por baixo. · Os genes (que também podem incluir recursos como promotores, introns, etc) são mostrados como arcos sobrejacente a espinha dorsal, com ou sem uma seta mostrando a direção (exemplo). O nome do gene pode ser arrastado para dentro ou para fora, e a cor de fundo, cor de texto e espessura do recurso podem ser alteradas. · Vários sites de clonagem são desenhados como arcos ancorados à backbone (exemplo). Os MCs podem ser arrastados para novas posições. · Os locais de restrição são anexados ao backbone (exemplo) e podem ser arrastados para novas posições. O que há de novo nesta versão: · Ovais, retângulos e flechas para anotações. · Posicionamento automático para enzimas e texto do gene. · Importar de relevo. · Converter sites de restrição para os sites de restrição MCS / MCS. · Alterar fontes de recurso em uma base individual. · Insira, copie e corte fragmentos por local de restrição. · Exportar para texto simples. · Importar DNA circular de Genbank corretamente. · O nome e a descrição do plasmídeo são móveis. · Determinar a resolução PNG e JPG na exportação. · Caixa de seleção para identificar orfs no Genbank durante a importação. · Alterar o atalho "inserir fragmento" de "? I" para "? V". · Alterar o atalho "Edit Plasmid Info" para "? I". · Ícone "Info" na barra de ferramentas para editar informações do plasmídeo. · Muitos bugfixes.

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