Viewmol. Ferramenta gráfica para programas de química computacional
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Viewmol. Descrição

Ferramenta gráfica para programas de química computacional ViewMol é uma extremidade gráfica de código aberto para programas de química computacional. O ViewMol é capaz de ajudar graficamente na geração de estruturas moleculares para cálculos e visualizar seus resultados. ViewMol é atualmente capaz de trabalhar com: Descubra arquivos, saídas DMOL3, saídas do gole, saídas do Mopac, arquivos PDB, saídas do PQS, arquivos de turbomole, saídas Gaussianas, saídas de gamess, saídas de gaussian e qualquer arquivo de estrutura molecular suportado por aqui são alguns Principais características de "ViewMol": · Edifício e edição de moléculas · Visualização da geometria de uma molécula como moldura, palito, bola e vara ou modelos CPK · Rastreamento de uma otimização de geometria ou uma trajetória MD · Animação de vibrações normais ou para mostrá-las como flechas · Desenho de IR, Raman e espectro de espalhamento de nêutrons inelásticos · Desenho de um nível de energia MO ou densidade de diagrama de estados · Desenho de funções de base, orbitais moleculares e densidades de elétrons · Desenho de propriedades definidas em uma grade · Exibição de forças agindo em cada átomo em uma determinada configuração · Cálculo de quantidades termodinâmicas para moléculas e reações entre eles · Desenhos gerados por ViewMol podem ser salvos como arquivos TIFF, PNG, HPGL ou PostScript · Animações de modos normais podem ser convertidos em um arquivo de vídeo (MPEG), e. g. Para inclusão em documentos da Web World Web (requer programas adicionais disponíveis na Internet) · Interface para o programa de rastreamento de raios povray (geração de arquivos de entrada e uso de povray de dentro do ViewMol) · Entrada e saída em uma variedade de formatos, novos formatos podem ser adicionados facilmente pelo usuário · Intérprete de Python incorporado para automação O que há de novo nesta versão: · Suporte para saídas Gaussian 03 · Suporte para saídas de vamp · Um recurso "atraso" para controlar a velocidade de animação · Interface do usuário em turco (incompleto) · Removida a dependência do libcxa.so introduzida pelo compilador Intel C · Algumas correções de bugs

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