Seqdiverse. uma ferramenta que mede a diversidade posicional de leituras de sequenciamento de próxima geração
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Seqdiverse. Classificação e resumo

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Seqdiverse. Descrição

Um passo importante no pipeline de análise de sequenciamento da próxima geração é determinar a qualidade das seqüências Fastq. Sequenciamento de artefatos tais (como leitura do adaptador, priming não tão aleatória, sequências codificadas e vieses de PCR) podem afetar a capacidade de discernir a verdadeira natureza dos dados. Além disso, as etapas de pré-alinhamento, como o corte, podem ser feitas para melhorar a sensibilidade do alinhamento. Seqdiverse é um aplicativo gratuito e de código aberto que pode exibir medidas de diversidade para seqüenciamento de dados que podem ajudar a identificar esses artefatos. Instruções detalhadas sobre como instalar e usar o utilitário SEQDiverse em seu Mac estão disponíveis aqui.Seqdiverse é um utilitário de plataforma cruzada capaz de executar em qualquer sistema operacional que vem com o suporte Java (e.g. Mac OS X, Windows, Linux).

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