Masqot-gui.

Aplicativo de controle de qualidade de ponto de código aberto e aberto
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Masqot-gui. Classificação e resumo

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Masqot-gui. Tag


Masqot-gui. Descrição

Aplicação de controle de qualidade de ponto de código aberto e aberto O Masqot-GUI fornece um pipeline de software de código aberto, independente de plataforma para controle de qualidade de microarray de duas canais. MASQOT-GUI inclui segmentação, quantificação, gridding, avaliação de qualidade e visualização de dados.masqot-gui hospeda três aplicações independentes (Masqotgrid, MasqotSeg e MasqotView) para este fim, com as interações entre as ferramentas, bem como suporte de importação e exportação para software externo.masqotgrid É um pedido de grade (endereçamento) de microarray DataRay Data.masqotseg é um pedido de segmentação de manchas de microarray com avaliação de controle de qualidade local multivariada integrada. O programa usa locais especiais (de MASQOTGRID ou de outros aplicativos de grade) e sai um conjunto de propriedades pontuais comuns, juntamente com a pontuação de qualidade do Masqot. MasqotView é um aplicativo para visualizar e re-sinalizar manchas de microarray. Spots selecionados, filtrados com base na pontuação de controle de qualidade do Masqot, serão cortadas e escaladas e podem ser posteriormente inspecionadas visualmente. Requisitos: · Java. O que há de novo nesta versão: · Masqot-GUI: Adicionado referência à publicação Nota de aplicativos Bioinformatics. · Masoqtview: O pedido de classificação do local é agora 'QC' por padrão. · MasqotView: O botão 'Remover da lista' não deixa mais entradas selecionadas devido a um erro de implementação anterior. · MasqotView: dimensões da janela de informações (quando o botão central clicando em um ponto) foi aumentado ligeiramente. · Masqotseg: O indicador "progresso geral" foi corrigido. · MasqotSeg: largura da caixa de diálogo de processamento agora é determinada pela largura da janela principal. · MasqotSeg: O botão 'Remover da lista' não deixa mais entradas selecionadas devido a um erro de implementação anterior. · Masqotseg: A lista de arquivos gerados foi corrigida (não contém mais apenas os arquivos gerados da última das grades processadas na lista). · Masqotseg: Agora possível ignorar questões relacionadas ao fundo (BG) marcando a caixa de seleção "Ignore BG Contaminants".


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