Genodivo Aplicativo amigável para realizar a análise da genética da população
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Genodivo Descrição

Aplicativo amigável para realizar a análise da genética da população Genodive é um aplicativo amigável para realizar a análise da genética da população. Possui uma interface de usuário intuitiva e sem confusão, atrás do qual esta força estatística poderosa. A Genodive pode lidar com dados genéticos, bem como matrizes de distância e dados ecológicos, permitindo que você combine dados de várias fontes diferentes em uma única análise. A Genodive apresenta várias análises que não estão disponíveis em outros programas, como clustering K-significa AMOVA, testes para reprodução clonal e AMOVA para dados poliploidais, e coeficientes padronizados de diferenciação populacional. E, melhor de todos, o Genodive funciona em um Mac! Aqui estão algumas características principais de "Genodive": · Muitos tipos diferentes de inferências: Genodive apresenta muitos tipos diferentes de inferências estatísticas, algumas das quais não estão disponíveis em qualquer outro software de genética populacional. Inferências incluídas estão entre outras: uma análise flexível da variância molecular, estimativa de coeficientes padronizados da diferenciação populacional, k-significa agrupamento de populações usando uma abordagem de recozimento simulada, atribuindo identidade genotípica (clones) a indivíduos, testes para reprodução clonal, testando Equilíbrio de Weinberg, cálculo do índice híbrido para indivíduos e diferentes tipos de testes de mantel. · Analisar vários conjuntos de dados ... simultaneamente! Todos os Macs que são vendidos hoje em dia contêm múltiplos núcleos do processador. No entanto, a maioria dos programas é capaz de usar apenas uma parte da energia desses novos computadores, pois emprega apenas um único processador de cada vez. O Genodive detecta automaticamente o número de processadores presentes no computador e divide longas tarefas sobre todos eles. Os cálculos sempre ocorrem no fundo, para que você possa executar outras análises enquanto aguarda os resultados de uma análise mais longa. · Vários formatos de dados: Genodive pode lidar com três tipos diferentes de dados: MarkerData (por exemplo, de microssatélites), matrizes de distância (por exemplo, distâncias genéticas em pares entre populações) e outros dados genéricos (por exemplo, as coordenadas de populações), que podem ser combinadas no inferências estatísticas. Importando dados para o Genodive é fácil: basta abrir um arquivo e genodive determinará automaticamente que tipo de dados é e carregará os dados na memória. A Genodive detectará se MarkerData está em Genodive, Fstat, Genepop, Spickedi, Genetix, Bayesass, Estrutura ou migrar. · Facilmente incluir e excluir observações: A maioria dos conjuntos de dados da vida real estão longe de ser perfeita, alguns loci podem ser mais difíceis de pontuar do que outros e sempre haverá indivíduos cuja extração de DNA produziu DNA de baixa qualidade. Na maioria dos programas, isso significa desistir do programa, editar o InputFile e, em seguida, reiniciando o programa novamente com o novo arquivo. Genodive torna fácil incluir ou excluir loci, indivíduos, clones, níveis de ploidia, populações ou até grupos inteiros de populações, então o efeito desses outliers sobre o resultado das análises pode ser avaliado. · Uma visão clara sobre seus dados: Genodive tem uma interface clara, organizada, que facilita para você manter uma visão geral de seus dados e análises. Você pode escolher entre visualizar seus dados como texto simples ou visualizá-lo como uma matriz. O painel do inspetor mostra as informações mais importantes para os dados atuais: Quantos indivíduos estão incluídos por população, o número de grupos de populações, que locos estão incluídos, o número de alelos por locus e um log com as análises que foram realizadas DataSet. · Extensivas Opções de pesquisa: Com o Genodive, você pode pesquisar seus dados de maneiras diferentes: pelo alelo, por nome individual, por população, por clone, ou por todas essas categorias ao mesmo tempo. A pesquisa pode ser muito específica: você pode, por exemplo, pesquisar todos os nomes de população que começam com a string "nl" ou todas as alelos que são mais de 150 bp.note: Esta é uma versão preliminar pública que nmeans que o aplicativo ainda contém bugs, e algumas análises ainda não estão totalmente implementadas. Se você usar esta versão beta, é obrigado por honra para relatar quaisquer problemas, insetos ou elogios que você possa ter ao autor. O que há de novo nesta versão: · Compatibilidade aprimorada com Mac OS 10.6 "Snow Leopard". · Possibilidade removida para mostrar a tela inicial na inicialização, pois isso pode levar a falhas. · Corrigido o erro na leitura do formato Genepop. · Reestruturação interna de procedimentos de atribuição.

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