Filosort Solução de código aberto que permitirá que você classifique árvores filogenéticas
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Filosort Classificação e resumo

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visualizar filtro organizar classificador filogenético TRILHÃO SORT. filtro filogenético

Filosort Descrição

Solução de código aberto que permitirá que você classifique árvores filogenéticas O Phylosort é uma ferramenta Java de código aberto que permitirá que você ordene árvores filogenéticas à procura de subtrees especificadas pelo usuário que contêm um grupo monofilético de juros definidos por unidades taxonômicas operacionais (Otus) .fylosort oferece dois modos de pesquisa, inclusive (padrão) e exclusivo : · No modo exclusivo, qualquer taxa do (s) grupo (s) de consulta existe na árvore, terá que estar localizado dentro do clado monofilético, a fim de qualificar esse clado e considerar a árvore como uma árvore. · No modo inclusivo , a restrição do modo exclusivo é relaxada de tal forma que um clado monofilético "qualificador" é aceito, independentemente de haver taxa adicional a partir do taxas de consulta localizado em outro lugar na árvore do lado de fora daquele clade. Aqui estão algumas características principais de "filostort": · Procurando por relacionamento monofilético entre grupos de táxons. · Filtrando por valores de suporte de bootstrap associados aos revestimentos monofiléticos. · Filtrando por complexidade da árvore (número de táxons em uma árvore). · Filtrando por complexidade familiar (número de genes por taxon em uma árvore). · Clustering árvores (genes) em clusters de árvores (famílias genéticas). · Agrupando Otus usando uma árvore de referência taxonômica. · Implementação limpa e reutilizável de procedimentos comuns para manipular a estrutura de dados de árvore, como análise de Newick, travessia de árvores e lixo. · Visualizar a topologia da árvore usando um visualizador de árvores (ATV).

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