Filococo Phylococo - uma ferramenta simples para estimativa filogenética molecular.
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Filococo Descrição

Phylococo - uma ferramenta simples para estimativa filogenética molecular. A filococo é uma ferramenta gratuita e minimalista para filogenética molecular que é capaz de reconstruir filogenias por meio do critério de probabilidade. A Phylococo seleciona automaticamente o melhor modelo de substituição da Evolução do DNA para o conjunto de dados de sequências a serem analisadas e exibidas após um curto período de tempo, o melhor até agora filogenia encontrado.Molecular filogenéticos Estudente as relações evolutivas hierárquicas entre os organismos por meio de dados moleculares. Estas relações são tipicamente descritas através de uma árvore ponderada, chamada filogenia, cujas folhas representam os organismos observados, os vértices internos representam os ancestrais intermediários, e as bordas representam relações evolucionárias entre pares de organismos.Aqui são algumas características importantes de "filococo": GTR MODELO DA EVOLUÇÃO DE DNA. · Distribuição gama para modelo entre a heterogeneidade da taxa local. · Direcções aleatórias, algoritmo de Brent e busca aleatória para otimização não linear irrestrita dos parâmetros da probabilidade. · Bairro de grande escala (VLSN) busca pela otimização de topologia. - Busca localitada (ILS) para explorar o espaço da solução. · Phylococo usa o paloalto para exibir o filogenia resultante.Requirements: · Um G4 ou um processador Duo de núcleo Intel · Java 1.4 ou superior. Recomendado: · Um núcleo Intel 2 Duo · Java 1.5 ou superior. O que há de novo nesta versão: · Melhora a velocidade e a estabilidade de toda a aplicação gráfica · Suporta Figtree 1.2.1

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