CLC RNA Workbench

Programa BioInformatics para análise avançada de seqüência de RNA.
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CLC RNA Workbench Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • CLC bio
  • Site do editor:
  • http://www.clcbio.com
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X 10.4 or later
  • Tamanho do arquivo:
  • 34.8 MB

CLC RNA Workbench Tag


CLC RNA Workbench Descrição

Programa BioInformatics para análise avançada de sequência de RNA. O Workbench CLC RNA fornece ao usuário fácil acesso a uma gama de algoritmos e opções complexos. As estruturas secundárias de RNA podem ser previstas usando algoritmos de minimização de energia livre de última geração. O Workbench RNA de Minimização de Energia é um programa BioInformatics para análise avançada de seqüência de RNA. Todas as análises são totalmente integradas em um único aplicativo de software, intuitiva e fácil de usar. Aqui estão algumas características principais da "CLC RNA Workbench": · Previsão de estrutura secundária. · Visualização gráfica e edição da estrutura secundária. · Visão tabular das estruturas e contribuições energéticas. · Representação simbólica em visão de seqüência. · Pesquisa por padrão. · Buscas de explosão. · Análises de seqüência geral. · Análises de nucleotídeos. · Alinhamento de seqüência. · Pontos de pontos. · Visualizador de gel virtual. Requisitos: · RAM de 256 MB necessária. 512 MB de RAM recomendado. · 1024 x 768 Exibição recomendada. Limitações: · 4 semanas de avaliação totalmente funcional. O que há de novo nesta versão: Desdobramento, desenvolvimento: · Você pode definir um caminho para o local de dados padrão usado quando a bancada de trabalho começar pela primeira vez. Este é um recurso para ajudar os administradores do sistema a controlar onde novas instalações por padrão salve seus dados. Consulte Mais informação... · Suporte para remover ferramentas acessando a Internet (BLAST NCBI, notificações de atualização etc). Consulte Mais informação... Importação e Exportação Geral: · Suporte para importação de regiões complexas de arquivos GFF · Exportar tabelas e relatórios no formato do Excel. · Seção de importação do manual do usuário reestruturada para fornecer melhor visão geral. Leia mais .... Os importadores de dados de expressão agora são descritos em detalhes técnicos em uma seção separada. Consulte Mais informação.... · Você pode agora exportar várias listas de seqüência no formato FASTA · Importação forçada de arquivos ZIP agora é suportada (ele forçará a importar o conteúdo do arquivo zip) · A importação padrão agora aceita arquivos GZIP e TAR, bem como Zip · Se uma importação forçada falhar, haverá informações mais técnicas sobre o que deu errado, permitindo identificar a má formatação dos arquivos de importação · Tanto o genbank e o importador GFF agora fazem várias tentativas de nomear genes que não têm um nome genético. Iterativamente tentar os seguintes qualificadores: "produto", "locus_tag", "protein_id" e "transcript_id" · Ao importar arquivos Genbank, onde o comprimento declarado não corresponde à seqüência real, um aviso é mostrado, mas a sequência é aceita. · Ao exportar no formato CSV, as configurações de localidade são usadas para determinar se vírgulas ou semi-colons devem ser usadas como delimitador (vírgula usada para localidades dos EUA) · Plug-in do GFF foi atualizado para aceitar anotações complexas Diversos: · Retipagem avançada de anotações usando a tabela de anotação. Consulte Mais informação... · Melhor relatório de situações em que um disco completo impede a economia de dados · O download de seqüências usando arrastar e soltar da tabela de pesquisa não cria mais um nó "download ..." na pasta. O processo de download pode ser monitorado na guia Processos. · Extrair sequências movidas do menu Arquivo para a caixa de ferramentas -> análise de seqüência geral. Consulte Mais informação... · Melhor feedback de progresso em vários diálogos Correções de bugs: · Problema fixo exibindo o rótulo "Copiando ..." ao copiar dados e atualizando a pasta · Problema fixo com a nomeação de guias. A correção significa que, no Windows e no Linux, os dados não salvos agora recebem um * em vez de fazer o nome da tabulação em negrito e itálico. (Isso sempre foi o comportamento no Mac OS X).


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