Workbench da proteína CLC.

Programa BioInformatics para análise avançada de sequência de proteína.
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Workbench da proteína CLC. Classificação e resumo

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  • CLC bio
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Workbench da proteína CLC. Tag


Workbench da proteína CLC. Descrição

Programa BioInformatics para análise avançada de sequência de proteína. O Workbench CLC Protein fornece uma ampla gama de análises de proteína avançadas e baseia-se no mesmo ambiente de software amigável e integrado, já que o CLC Free WorkBench.clc Protein Workbench é uma solução de software para cientistas e pesquisadores de laboratório que trabalham com bioquímica. Aqui estão algumas características principais de "CLC Protein Workbench": · Visualizador molecular 3D desintegrado. · 2 tipos de alinhamentos. · Filogenética. · Previsão de estrutura de proteína secundária. · Predição de peptídeos de sinal (sinalp). · Previsão de hélice Transmembrana (TMHMM). · Pesquisa de motivo (padrões conhecidos). · Descoberta padrão (padrões desconhecidos). · EXPLOSÃO. · Processamento em lote de várias análises em um passo de trabalho. · Análise da família Proteína (PFAM). · Pontos de pontos. · Análises de hidrofobicidade. · Análises de antigenicidade. · Pesquisas no Genbank, Swiss-Prot, Trembl e PubMed. · Registro detalhado de ações / análises realizadas. Requisitos: · RAM de 256 MB necessária. 512 MB de RAM recomendado. · 1024 x 768 Exibição recomendada. Limitações: · 4 semanas Período de avaliação totalmente funcional. O que há de novo nesta versão: Desdobramento, desenvolvimento: · Você pode definir um caminho para o local de dados padrão usado quando a bancada de trabalho começar pela primeira vez. Este é um recurso para ajudar os administradores do sistema a controlar onde novas instalações por padrão salve seus dados. Consulte Mais informação... · Suporte para remover ferramentas acessando a Internet (BLAST NCBI, notificações de atualização etc). Consulte Mais informação... Importação e Exportação Geral: · Suporte para importação de regiões complexas de arquivos GFF · Exportar tabelas e relatórios no formato do Excel. · Seção de importação do manual do usuário reestruturada para fornecer melhor visão geral. Leia mais .... Os importadores de dados de expressão agora são descritos em detalhes técnicos em uma seção separada. Consulte Mais informação.... · Você pode agora exportar várias listas de seqüência no formato FASTA · Importação forçada de arquivos ZIP agora é suportada (ele forçará a importar o conteúdo do arquivo zip) · A importação padrão agora aceita arquivos GZIP e TAR, bem como Zip · Se uma importação forçada falhar, haverá informações mais técnicas sobre o que deu errado, permitindo identificar a má formatação dos arquivos de importação · Tanto o genbank e o importador GFF agora fazem várias tentativas de nomear genes que não têm um nome genético. Iterativamente tentar os seguintes qualificadores: "produto", "locus_tag", "protein_id" e "transcript_id" · Ao importar arquivos Genbank, onde o comprimento declarado não corresponde à seqüência real, um aviso é mostrado, mas a sequência é aceita. · Ao exportar no formato CSV, as configurações de localidade são usadas para determinar se vírgulas ou semi-colons devem ser usadas como delimitador (vírgula usada para localidades dos EUA) · Plug-in do GFF foi atualizado para aceitar anotações complexas Diversos: · Retipagem avançada de anotações usando a tabela de anotação. Consulte Mais informação... · Melhor relatório de situações em que um disco completo impede a economia de dados · O download de seqüências usando arrastar e soltar da tabela de pesquisa não cria mais um nó "download ..." na pasta. O processo de download pode ser monitorado na guia Processos. · Extrair sequências movidas do menu Arquivo para a caixa de ferramentas -> análise de seqüência geral. Consulte Mais informação... · Melhor feedback de progresso em vários diálogos Correções de bugs: · Problema fixo exibindo o rótulo "Copiando ..." ao copiar dados e atualizando a pasta · Problema fixo com a nomeação de guias. A correção significa que, no Windows e no Linux, os dados não salvos agora recebem um * em vez de fazer o nome da tabulação em negrito e itálico. (Isso sempre foi o comportamento no Mac OS X).


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