Pacote :: bioperl.

Um pacote para instalar módulos de CPAN externos usados pelo BioPerl 1.5.2
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Pacote :: bioperl. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Perl Artistic License
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • Chris Dagdigian
  • Site do editor:
  • http://search.cpan.org/~craffi/

Pacote :: bioperl. Tag


Pacote :: bioperl. Descrição

Um pacote para instalar módulos de CPAN externos usados pelo BioPerl 1.5.2 Bundle :: BioPerl é um módulo Perl que não contém funcionalidade ou código real em tudo. A distribuição do bioperl da http://bioperl.org contém código e módulos que podem usar ou requerem módulos de perl 'externos' adicionais para funcionalidades avançadas. Muitos dos módulos externos não estão contidos dentro da distribuição padrão do Perl. Esses módulos externos podem ser obtidos na abrangente Rede de Arquivo Perl (CPAN) localizada em http: //www.cpan.org.note: O mais recente lançamento deste pacote inclui todos os módulos CPAN externos listados como dependências do funcionário BioPerl 1.5.2 codebase lançamento. As únicas exceções são os módulos DBD :: e DBI :: que são realmente melhor desligados em seus próprios se você tiver uma necessidade de carregar e consultar relacional. bancos de dados. Esses módulos não são necessários - eles estendem muito a funcionalidade do bioperl de várias maneiras. Para obter o melhor uso do Bioperl, particularmente após o lançamento do BioPerl 1.0 Recomendamos pelo menos tendo o LWP :: Network Access e os módulos relacionados XML, instalados.bundle :: bioperl é um módulo Perl que não contém funcionalidade ou código real em absoluto. É essencialmente um módulo especial de Perl destinado a ser usado pelo módulo CPAN.PM para simplificar a tarefa de instalar automaticamente vários módulos em uma etapa fácil.Sessencialmente, os usuários podem dizer cpan.pm para 'instalar pacote :: bioperl' e cpan.pm O download, instalará e configurará todos os módulos listados no módulo Bioperl Bundle. Consulte a seção Sinopse ou do PerlDoc CPAN para aprender sobre como usar o módulo CPAN.PM para instalar os Bundles.note: Esse processo é complicado pelo fato de que alguns módulos externos do Bioperl possuem suas próprias dependências e pré-requisitos. Em particular, o módulo XML :: Parser requer a instalação prévia do pacote 'xpat', que reside fora do CPAN em Processo de instalação :: O processo do BioPerl pode precisar ser repetido vários vezes para concluir a instalação completa de todos os módulos listados. Alguns módulos externos são complicados ou podem ter dependências.Note: Este pacote não instala o BioPerl :) Apenas os módulos adicionais que o código bioperl ocasionalmente faz uso. Você ainda precisará obter a distribuição do BioPerl do CPAN ou http://bioperl.org e instalá-lo a maneira usual: perl makefile.pl para fazer o teste Fazer o InstallCPan.pm tem muitos recursos - incluindo a capacidade de baixar, mas não instalar o Módulos listados no pacote BioPerl.SynopsisPerl Um liner usando cpan.pm: perl -mcpan -e 'install bundle :: bioperl'use of cpan.pm no modo interativo: $> perl -mcpan -e shell cpan> install bundle :: BioPerl CPAN> QuitJust Gosta da instalação manual de módulos Perl, o usuário pode precisar de acesso root durante esse processo para garantir permissão de gravação é permitido no diretório de intestação. Requisitos: · Perl.


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