Antz.
Um ambiente multidimensional imersivo para análise de dados em tempo real e tomada de decisão. ...
 | Macs2.Análise baseada em modelo para dados Chip-SEQ |
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Macs2. Classificação e resumo
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- Licença:
- Artistic License
- Preço:
- FREE
- Nome do editor:
- Tao Liu
- Site do editor:
- http://github.com/taoliu/
Macs2. Tag
Macs2. Descrição
O Macs2 é uma ferramenta de análise baseada em modelo para dados do Chip-SEQ. Com a melhoria das técnicas de sequenciamento, a imunoprecipitação de cromatina seguida de sequenciamento de alta taxa de transferência (chip-seq) está se tornando popular para estudar interações de proteína genômica. Para abordar a falta de poderoso método de análise do chip-seq, apresentamos um romance algoritmo, denominado análise baseada em modelo do Chip-SEQ (Macs), para identificar sites de ligação ao fator de transcrição. Macs captura a influência da complexidade do genoma para avaliar a importância das regiões de chip enriquecidas, e Macs melhora a resolução espacial dos locais de ligação através da combinação das informações da posição e orientação do seqüenciamento da tag. Os Macs podem ser facilmente usados para dados do Chip-SEQ, ou com amostra de controle com o aumento da página inicial da especificidade.
Macs2. Software Relacionado
