Bio :: gmod. Bio :: GMOD é uma API unificada para bancos de dados de organismos de modelos.
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Bio :: gmod. Classificação e resumo

Bio :: gmod. Tag

Módulo Perl. API. Unificado API unificada Organismo Modelo Databases

Bio :: gmod. Descrição

Bio :: GMOD é uma API unificada para bancos de dados de organismos de modelos. Bio :: GMOD é uma API unificada para bancos de dados de organismos de modelos.synopsischeck A versão instalada de um mod Uso Bio :: GMOD :: Util :: Checkfersions.pm Meu $ Mod = Bio :: GMOD :: Util :: Checkersions-> Novo (-mod => 'wormbase'); Minha $ Version = $ Mod-> Live_version; Atualizar uma instalação Mod Use Bio :: Gmod :: Atualização; meu $ mod = bio :: gmod :: update-> novo (-mod => 'wormBase'); $ gmod-> update (); buscar uma lista de genes de um mod use bio :: gmod :: consulta; Meu $ Mod = Bio :: Gmod :: Query-> Novo (-Mod => 'WormBase'); Meus @Genes = $ mod-> Fetch (-Class => 'Gene', - Nome => 'Unc-26'); Bio :: GMOD é uma API unificada para acessar vários bancos de dados de organismos de modelos. É uma parte do projeto Generic Model Organism Database, bem como distribuído em CPAN.Mods são recursos altamente curados de dados biológicos. Embora tipicamente incorporem dados de sequência alojados em repositórios comunitários, como o NCBI, colocam essas informações dentro de uma estrutura de fução biológica gelanada da literatura publicada de experimentos em organismos modelos. Divido a grande proliferação de mods, as estratégias de mineração de dados cruzados foram difícil de implementar. Essas estratégias precisam de uma familiaridade com o modelo de dados subjacente e o vocabulário histórico do sistema do modelo.Furthermore, a natureza em evolução desses projetos fez instalar um mod localmente e mantê-lo atualizado um delicado e experiência de consumo. Requisitos: · Perl.

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