Bio :: AnotationCollectioni. Bio :: anotationcollectioni é uma interface Perl para coleções de anotação.
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Bio :: AnotationCollectioni. Classificação e resumo

Bio :: AnotationCollectioni. Tag

Módulo Perl. interface perl Interface Perl. coleções de anotação

Bio :: AnotationCollectioni. Descrição

Bio :: AnotationCollectioni é uma interface Perl para coleções de anotação. Bio :: AnotationCollectioni é uma interface Perl para coleções de anotação.synopsis # Obtenha um anotationcollectioni de alguma forma, por exemplo $ AC = $ SEQ-> anotação (); foreach $ tecla ($ AC-> get_all_annotation_keys ()) {@Values = $ AC-> get_annotações ($ tecla); foreach $ Value (@Values) {# valor é um bio :: anotationi, e define um método "AS_TEXT" Imprimir "Anotação", $ Key, "Valor Stringificado", $ Value-> AS_TEXT, "N"; # Também definiu o método hash_tree, que permite o acesso à versão # orientado a dados neste objeto $ hash = $ value-> hash_tree (); }} As coleções de anotação são uma maneira de armazenar uma série de "fatos interessantes" sobre algo. Chamamos um "fato interessante" na anotação do BioProperl (isso difere de um recurso de sequência, que é chamado de recurso de seqüência e pode ou não ter uma coleção de anotação). O problema sobre isso é que não somos que "fatos interessantes" "Alguém pode querer armazenar: a possibilidade é a abordagem infinita.bioperl é que os" fatos interessantes "são representados por objetos Bio :: Annotationi. A interface Bio :: Annotationi Guareiva dois métodos $ Obj-> AS_TEXT (); # string formada para exibir para Usersand $ obj-> hash_tree (); # Hash com regras definidas para o método Hash_tree Orientado por Dados é projetado para reproduzir bem com saída XML e outros "Nested-Tag-Tag-Data-Values" pensam Boulderio e / ou Ace Stuff. Para mais informações, leia Bio :: Anotationi Docsannotações são armazenados em anotationcollections, cada anotação sob uma "tag" diferente. As tags permitem a descoberta simples das anotações disponíveis e, em alguns casos (como a tag "gene_name"), indica como interpretar os dados abaixo da tag. A tag é apenas uma etiqueta de profundidade e cada tag pode ter uma matriz de valores.in Além disso, a anotaçãoCollectioni é garantia para manter um conjunto de objetos de ajuste consistentes em cada tag - pelo menos que cada objeto está em conformidade com uma interface. O anotationcollection "padrão" insiste que as seguintes regras sejam configuradas objeto de tag --- ------ comentário Bio :: Anotation :: comentário DBLink Bio :: Annotation :: Dblink Descrição Bio :: Anotação :: SimpleValue Gene_Name Bio: : Anotação :: SimpleValue Ontology_term Bio :: Anotação :: OntologyTerm Referência Bio :: Anotação :: As tags referenciadas são as tags de implícitos que o sistema SEQIO precisa para a Genbank / Embl / SwissProt de ida e volta. No entanto, você como usuário e US Como uma comunidade pode aumentar o mapeamento de tags "padrão" ao longo do tempo e especificamente para uma área específica. O que é novo nesta versão: · Perl

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