Bio :: Nexus :: setsblock Bio :: Nexus :: setsblock é um módulo Perl que representa o bloco de conjuntos de um arquivo Nexus.
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Bio :: Nexus :: setsblock Classificação e resumo

Bio :: Nexus :: setsblock Tag

quadra Módulo Perl. Conjuntos. Arquivo Nexus. Define o bloco

Bio :: Nexus :: setsblock Descrição

Bio :: Nexus :: setsblock é um módulo Perl que representa define o bloco de um arquivo Nexus. Bio :: Nexus :: setsblock é um módulo Perl que representa bloco de conjuntos de um arquivo nexus.synopsis $ block_object = New Bio :: Nexus :: setsblock ($ block_type, $ bloco, $ verbose); parses conjuntos bloco de arquivo nexus e Lojas Define Data.MethodsNew Title: New Block_Object = New Bio :: Nexus :: SetsBlock ($ block_type, $ Commands, $ verbose) Função: cria um novo Bio :: Nexus :: setsblock objeto retorna: Bio :: nexus :: SetsBlock Object Args: Digite (string), os comandos / comentários para analisar (array ref) e um sinalizador verboso (0 ou 1) set_taxsets Título: set_taxsets Uso: $ block-> set_taxsets ($ taxsets); Função: Defina os Taxsets Hash Returns: Nenhum Args: Hash de Set Name Teclas e Element ArraysAdd_TaxSets Título: Add_TaxSets Uso: $ block-> add_taxsets ($ taxsets); Função: Add Taxa Sets Retorna: Nenhum Args: Uma referência a um hash de SetsGet_TaxSets Title: get_taxsets Uso: $ block-> get_taxsets (); Função: Retorna um hash de retornos de conjuntos de táxons: Taxa Sets Args: não éget_taxset Title: get_taxset Uso: $ block-> get_taxset ($ setname); Função: Retorna uma lista de retornos de Otu: Otu's Args: Names Title: get_taxset_names Uso: $ block-> get_taxset_names () Função: Obtém os nomes de todos os conjuntos de retornos: Array de nomes ARGS: Nenhumprint_all_taxsets Título: Print_All_taxsets Uso: $ block-> Print_All_TaxSets ($ Outfile) Função: Impressões Definir Nomes e Elementos Retornos: Nenhum Args: Nome do arquivo ou filehandledelete_taxsets Título: delete_taxsets Uso: $ bloco-> delete_taxsets ($ set1 ) Função: Remove os conjuntos nomeados de Os define block returns: Nenhum Args: nomes de sets para ser deletedExclude_otus title: exclude_otus Uso: $ block-> exclude_otus ($ Otu_array_REF) Função: Encontre e exclui cada um dos Otus determinados de quaisquer conjuntos que eles aparecem em retornos: nenhum ARGS: nomes de Otus para ser removidoSelecionar_otus Título: Select_otus Uso: $ block-> select_otus ($ Otu_array_REF) Função: encontra o OTUS fornecido e remove todos os outros de quaisquer conjuntos que aparecem em retornos: nenhum ARGS: nomes de Otus a serem removidosam E_otus Título: Rename_otus Uso: $ block-> rename_otus ($ nomes); Função: Renomear todos os Devolvos Otus: Nenhum Args: Hash de Otu NamesRename_TaxSets Título: Rename_TaxSets Uso: $ bloco-> Rename_Taxsets ($ oldsetname1, $ newsetname1, ...) Função: Renames Devoluções Retornos: Nenhum Args: OldName, Newname Pauloalsequalhes Nome: é igual a uso: $ setsblock-> é igual a ($ outro); Função: Compare se dois Objetos Bio :: Nexus :: SetsBlock são retornos iguais: BOOLAN ARGS: A BIO :: NEXUS :: SETSBLOCK Requisitos: · Perl.

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