Bio :: Nexus :: distancesblock Bio :: nexus :: distancesblock é um módulo Perl que representa bloco de distâncias no arquivo nexus.
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Bio :: Nexus :: distancesblock Classificação e resumo

Bio :: Nexus :: distancesblock Tag

quadra Módulo Perl. Arquivo Nexus. bloco DISTÂNCIAS DISTÂNCIAS

Bio :: Nexus :: distancesblock Descrição

Bio :: Nexus :: distancesblock é um módulo Perl que representa bloco de distâncias no arquivo Nexus. Bio :: Nexus :: Distancesblock é um módulo Perl que representa blocos de distâncias no arquivo Nexus. A classe DistânciaBlock representa um bloco de distâncias do Nexus e fornece métodos para leitura, escrita e acesso a dados dentro desses blocos. Os blocos de distâncias contêm matrizes de distância, ou uma tabela de distâncias calculadas entre cada par possível de táxons.Methodsnew title: Novo uso: block_object = New Bio :: Nexus :: distânciasblock ($ block_type, $ comandos, $ verbose, $ taxa); Função: Cria um novo Bio :: Distânciasblock Objeto Retorna: Bio :: Nexus :: DistânciasBlock Object Args: Digite (string), os comandos / comentários para analisar (array ref) e um sinalizador detalhado (0 ou 1) Get_Matrix Title: Get_Matrix Uso: $ matriz = $ self-> get_matrix (); Função: Recupera os retornos da matriz de distância: um hashref de hashref args: Nenhum Nota: os valores de distância podem ser recuperados especificando as teclas de linha e coluna, e. $ DIST = $ Matrix -> {$ row_taxon} {$ col_taxon} get_distances_for Título: get_distances_for Uso:% taxon1_distances =% {$ auto-> get_distances_for ($ first_taxon)}; Função: Recupera uma linha do Distance Matrix retornos: Args: O rótulo da linha (um taxlabel) para a linha desejada (string) get_distance_between Título: get_distance_between: $ Distance = $ self-> get_distance_between ($ row_taxon, $ column_taxon); Função: Recupera uma célula dos retornos da matriz: um escalar (número) args: as etiquetas de linha e coluna (tanto taxa) para a nota desejada da célula: Geralmente get_distance_between ($ A, $ B) == Get_Distance_Between ($ B, $ A ); No entanto, isso não é verdade se a matriz de distância não for simétrica. Certifique-se de que você está pedindo a distância desejada. Requisitos: · Perl.

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