Bio :: Nexus :: desalinhadoblock Bio :: Nexus :: UnalignedBlock é um módulo Perl que representa um bloco desalinhado de um arquivo Nexus.
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Bio :: Nexus :: UnalignedBlock é um módulo Perl que representa um bloco desalinhado de um arquivo Nexus. Bio :: Nexus :: UnalignedBlock é um módulo Perl que representa um bloco desalinhado de um arquivo nexus.synopsis se ($ tipo = ~ / desalinhado / i) {$ block_object = New Bio :: Nexus :: UnalignedBlock ($ tipo, $ bloco, $ verbose); } Esta é uma aula representando um bloco desalinhado no Nexus FileMethodsnew title: novo uso: block_object = New Bio :: Nexus :: UnalignedBlock ($ block_type, $ comandos, $ verbose, $ taxlabels); Função: cria um novo Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Object retorna: Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Object Args: Digite (string), os comandos / comentários para analisar (array ref) e um sinalizador verboso (0 ou 1) Find_Taxon Title: Find_Taxon Uso: My $ is_taxon_present = $ self-> Find_taxon ($ taxon_name); Função: Encontra se o nome do táxon de entrada está presente no rótulo de taxon. Retorna: 0 (não presente) ou 1 (se presente). Args: Taxon Label (como string) set_format Title: set_format Uso: $ block-> set_format (% formato); Função: Defina o formato dos Caracteres Retorna: Nenhum Args: Hash of Format ValuesGet_Format Título: Get_Format Uso: $ block-> get_format (); Função: Retorna o formato dos caracteres retorna: Hash de valores de formato Args: Noneset_otuset Título: set_otuset Uso: $ block-> set_otuset ($ Otuset); Função: Defina os retornos do OTUS: Nenhum Args: TaxUnitset ObjectSet_CharstateLabels Título: set_charstatelabels Uso: $ block-> set_charstatelabels ($ etiquetas); Função: Defina os nomes de caracteres e os estados retornos: Nenhum Args: Array de Personagem estadualG_Charstatelabels Título: get_charstatelabels Uso: $ set-> get_charstatelabels (); Função: Retorna uma matriz de estados de caracteres Retorna: Caractere States Args: não etget_ntax Title: get_ntax Uso: $ block-> get_ntax (); Função: Retorna o número de taxas dos retornos do bloco: # Taxa Args: Nonerename_otus Título: Rename_otus Uso: $ block-> rename_otus (% tradução); Função: Rename todos os Otus para outra coisa Retorna: Nenhum Args: Hash Conectando o nome de tradução: é igual a uso: $ block-> é igual ($ outro); Função: Compare se dois Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Objects são retornos iguais: BOOLEAN ARGS: A BIO :: NEXUS :: PersonagensBlock Requisitos do objeto: · Perl.

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