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Acesso ao estilo DAS a um banco de dados de Chado
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Bio :: DB :: Das :: Chado Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Perl Artistic License
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  • Scott Cain
  • Site do editor:
  • http://search.cpan.org/~scain/

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Bio :: DB :: Das :: Chado Descrição

Acesso ao estilo DAS a um banco de dados de Chado Chado é o esquema de banco de dados do GMOD, e Chado é uma instância específica dela. Ainda é um alvo em movimento, portanto, este pacote provavelmente exigirá várias atualizações nos próximos meses para mantê-lo funcionando.bio::Db::DAS::Chado é um módulo Perl que fornece acesso ao estilo DAS para um banco de dados de Chado .Synopsis # abre um banco de dados de recurso $ db = bio :: db :: dos :: chado-> novo (-dsn => 'dbi => dbi: pg: dbname = gadfly; host = lajolla' -User => 'jimbo', -Pass => 'supersecret',); @Segments = $ db-> segmento (-Name => '2l', -start => 1, -end => 1000000); # segmentos são Bio :: Das :: Segmenti - Objetos compatíveis # buscar uma lista de recursos @Features = $ db-> Recursos (-type => ); # Invoque um callback sobre recursos $ db-> recursos (-type => , -callback => sub {...}); # Obtenha todos os tipos de recursos @Types = $ db-> Tipos; # contagem de tipos% tipos = $ db-> tipos (-enumerate => 1); @Featur = $ db-> get_feature_by_name ($ classe => $ nome); @Featur = $ db-> get_feature_by_target ($ target_name); @Featur = $ db-> get_feature_by_attribute ($ att1 => $ value1, $ att2 => $ value2); $ recurso = $ db-> get_feature_by_id ($ ID); $ error = $ db-> erro; Requisitos: · Perl.


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