Probabilidade de sinapomorfia

Avaliar a sinapomorfia de árvores filogenéticas com a ajuda desta ferramenta
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Probabilidade de sinapomorfia Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • Martin Turjak
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Probabilidade de sinapomorfia Tag


Probabilidade de sinapomorfia Descrição

A probabilidade de sinapomorfia foi projetada como um script R que implementa um novo método para avaliar a sinapomorfia em árvores filogenéticas. Tudo o que você precisa fazer é instalar r e executar o script. Um método que quantifica o padrão de distribuição do estado de caractere sobre um cladograma e como tal é livre de qualquer modelo de transformação. A condição é definida para um estado de caractere totalmente sinapomórfico como estado de caractere compartilhado por todos os táxons terminais do clado e, ao mesmo tempo, completamente ausente de todos os táxons terminais fora desse clade. A medida em que esta condição não é violada serve para quantificar a probabilidade de sinapomorfia. Essa probabilidade é calculada como uma combinação de freqüências de estado de caráter relativas dentro e fora do clado com base na estrutura hierárquica do cladograma. Corresponde à probabilidade de selecionar aleatoriamente dois terminais que compartilham o mesmo estado de caractere dentro do clado e, ao mesmo tempo, diferem de todos os terminais externos.


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