Cytosed. Gerencie seus modelos metabólicos com a ajuda desta ferramenta
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Cytosed. Classificação e resumo

Cytosed. Tag

plugar viewer. manipulador Plugin de cytoscape

Cytosed. Descrição

O Cytoseed foi construído como plugin de cytoscape que pode ajudá-lo a visualizar, manipular e analisar modelos metabólicos criados usando a semente do modelo. O plugin cytosed foi projetado para permitir que os usuários da semente modelo criasse visualizações informativas das redes reaccionais geradas por seus organismos de interesse. Os usuários podem carregar qualquer modelo para o qual eles têm acesso na semente do modelo. O plug-in cytosed dove os dados do modelo, as reações e os compostos da semente do modelo e organiza as reações em redes baseadas em seus correspondentes mapas do caminho KEGG. Após a carga inicial (que pode levar vários minutos), os dados do modelo são armazenados na área de trabalho do usuário em uma pasta especificada para carga rápida em sessões subseqüentes. Principais características: baixando modelos da semente modelo; Criação de sessões de citsocape para visualização de modelos; Salvando e reabertura de sessões de citsocape Criação e exclusão de mapas de caminho; Movendo / copiando reações entre mapas de caminho; Escondendo / mostrando nós dentro dos mapas do caminho Visualização da análise de variabilidade do fluxo resulta em múltiplas mídias; Reações são coloridas com base em categorias essenciais / ativas / ativas / inativas / li] Capacidade para abrir modelos para vários organismos em uma sessão de citsocape, para permitir a análise de modelo comparativa Visualização de resultados de análise de equilíbrio de fluxo

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