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TFM-Explorer. Classificação e resumo
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- Licença:
- Freeware
- Nome do editor:
- Bonsai Bioinformatics group
- Sistemas operacionais:
- Windows All
- Tamanho do arquivo:
- 11.3 MB
TFM-Explorer. Tag
TFM-Explorer. Descrição
O TFM-Explorer é um programa para analisar regiões regulatórias de genomas eucarióticos. É preciso um conjunto de seqüências genéticas cercadas e busca por locais de acordo com o fator de transcrição superepresentado localmente. O algoritmo prossegue em duas etapas: · Escaneamento de seqüências para detectar todos os locais potenciais de ligação de fator de transcrição, usando matrizes de peso de Jaspar ou Transfac · Extraia clusters significativos (região das seqüências de entrada associadas a um fator) calculada uma função de pontuação O TFM-Explorer permite também visualizar os clusters de resultados e seus fator de transcrição putativos que compartilham sites nas seqüências de entrada e pesquisar os módulos regulatórios CIS. Obtenha o TFM-Explorer e dê uma visite o que pode realmente fazer por você!
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