Isoem. Ferramenta Java para ajudá-lo com sua pesquisa
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Isoem. Classificação e resumo

Isoem. Tag

expressão seqüência expressão genetica gene Sequência de RNA.

Isoem. Descrição

O aplicativo ISOEM é uma ferramenta baseada em Java que pode ser usada para inferir níveis de expressão de isoforma e gene de dados de sequenciamento de transcriptores de alta rendimento (RNA-SEQ). A ISOEM usa um novo algoritmo de maximização de expectativa que explora a leitura de informações de desambiguação fornecidas pela distribuição de tamanhos de inserção gerados durante a preparação da biblioteca de sequenciamento, e aproveita as pontuações de qualidade de base, a cadeia e a leitura de informações de pareamento. Experimentos empíricos em conjuntos de dados sintéticos mostram que o algoritmo superou significativamente os métodos existentes de ISOFORM e estimativa de nível de expressão gênica dos dados do RNA-SEQ.

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