Fpocket

Uma plataforma de código aberto para detecção de bolso do ligando
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Fpocket Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Vincent Le Guilloux
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 5.2 MB

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Fpocket Descrição

O FPocket é um algoritmo de detecção de bolso de proteína de código aberto (cavidade) que é baseado na tesselação voronoi. Foi desenvolvido na linguagem C Programming e está atualmente disponível como programa de linha de comando acionado. Uma GUI está em desenvolvimento e MDPocket (FPocket em trajetórias MD) está fora agora. O FPocket inclui dois outros programas (Dpocket e tpocket) que permitem extrair descritores de bolso e funções de pontuação própria do teste, respectivamente. Além disso, um escore de predição de droga bacana foi adicionado ao fpocket recentemente. Como o algoritmo é muito rápido, ele pode ser usado em um nível de grande escala (tamanho PDB, por exemplo).


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