Caryoscope. Visualização de dados de expressão em um contexto inteiro de genoma.
Baixe Agora

Caryoscope. Classificação e resumo

Caryoscope. Tag

viewer. ver dados do gene. Dados de expressão

Caryoscope. Descrição

O caryoscópio é um componente reutilizável da UI Java e um conjunto de utilitários de análise, ferramentas de linha de comando e uma GUI de aplicativos para visualizar dados de expressão gênica em um contexto inteiro de genoma. O caryoscope é um pacote de software que permite exibir e explorar dados numéricos como uma função da posição genômica. Por exemplo, o caryoscópio foi usado para "desenhar" dados de microarray em um conjunto de cromossomos para que as alterações no número de cópia de DNA possam identificar regiões de perda ou duplicação de cromossômicos dentro do genoma das células tumorais (Genet NAT. 1999 SEP; 23 (1) : 41-6). Além disso, os dados de microarray que medem os níveis de expressão de ARNm também podem ser visualizados em um contexto genômico usando o caryoscópio (PNAS 2002 DEC 10; 99 (25): 16144-9). Os dados visualizados com cariscope não precisam ser limitados a dados de microarray - qualquer tipo de dados numéricos que possam ser representados como uma função da posição genômica pode ser visualizado usando o caryoscópio. Receba caryoscope e experimente ver o que é tudo!

Caryoscope. Software Relacionado