Phire Pesquisas em sequências do genoma de bacteriófago para blocos que exibem similaridade de seqüência.
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Phire Classificação e resumo

Phire Tag

pesquisador similaridade de cor semelhança Similaridade variável saliente genoma do navegador Anotar genoma Visualize Genome Genome vista similaridade Exibir seqüência de imagens Search Genome Sequence. pesquisador sequência do genoma encontrar genoma sequência bacteriófago analisar genoma Análise do genoma Veja o genoma múltiplo. Pesquisar genoma. Veja a sequência do genoma. Genoma Sequence Viewer. Exibir seqüência genoma. ver dados do genoma. navegar pelo genoma ver o genoma linguagem genoma. Algoritmo de similaridade de texto genoma procariotas Análise do genoma da Arabidopsis. Veja o genoma do Arabidopsis. Analise o genoma da Arabidopsis. Analise o genoma bacteriano Visualização do genoma. genoma Visualizador associação em todo o genoma tipo de similaridade Similaridade da seqüência comparar genoma sequência comparação de sequências do genoma Sequência do genoma. Rastreamento do navegador do genoma da UCSC Veja o arquivo do genoma. Exibir dados do genoma. Sequência do genoma bacteriana Genoma Explorer. Genoma microbiano caracterizar o genoma. Caracterização do genoma. Veja o genoma bacteriano semelhança de imagem Porcentagem de similaridade Similaridade visual

Phire Descrição

O programa Phire, um programa autônomo no Visual Basic, realiza uma busca baseada em string algorítmica em sequências de genoma de bacteriófago, descobrindo e extraindo blocos exibindo semelhança de seqüência, correspondendo a elementos regulatórios conservados contidos dentro desses genomas de maneira sistemática, sem qualquer experiência experimental ou Conhecimento preditivo. O phire compara sistematicamente todas as subestritos de DNA de um comprimento especificado (l) um ao outro, permitindo um número limitado de incompatibilidades (degeneração D) para classificar e extrair os maiores conjuntos (dominantnum) de substrings que representam um consenso único. Dessa forma, todo o genoma será analisado no Watson e no Strand DNA de Crick também. Para visualizar as seqüências ao redor da seqüência consensual, o tamanho da janela (W) pode ser adaptado para incluir as seqüências deixadas e à direita de cada string individual de DNA selecionada.

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