Fragmentationanalyzer. Uma ferramenta Java autônoma para analisar dados de fragmentação MS / MS
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Fragmentationanalyzer. Classificação e resumo

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Fragmentationanalyzer. Descrição

Analisador de fragmentação é um instrumento de código aberto baseado em Java que pode ser usado para analisar dados de fragmentação MS / MS. Nove tipos de análise diferentes são suportados: · Visualização do espectro - Visualize os espectros MS / MS com anotação de íons de fragmentos, zoom e teste de novo-novo-sequenciamento. · Plotas de caixa de intensidade - Analisar a variação de intensidade para um conjunto de identificação do mesmo péptido. · Correlação de intensidade - Detecte como a intensidade se correlaciona com a disseminação em intensidade. · Meta de intensidade - analisar ainda mais as variações de intensidade. · Entradores de disposição de erro de massa - Visualize o erro de massa espalhado em um conjunto de identificações / espectros selecionados. · Entradores de bolha de erro de massa - mesmo que as parcelas de dispersão de erro de massa, mas com pico de intensidades adicionadas. · Plot de caixa de erro de massa - analise a variação nos erros de massa. · Criação de probabilidade de íons fragment - analise a probabilidade de observar íons específicos de fragmentos. · Mapa de calor do fragmento - compare fragmentação usando mapas de calor de dados de correlação. Principais características: suporta três formatos de entrada: ms_lims 7 mascot dat arquivos OMSSA OMX arquivos

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