Dnassist. Um programa para a edição e análise de dados de sequência de biologia molecular
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Dnassist. Descrição

Leia o papel no dnassist em bioinformática veja o capítulo do livro em dnassist DN Ajuda fornece uma interface intuitiva e única em quais arquivos de seqüência são exibido, editado e analisado. Várias janelas do editor podem estar abertas, e o usuário pode funcionar em qualquer uma dessas janelas simplesmente trazendo para o topo. A janela do editor é semelhante a um processador de texto janela, e sequências podem ser inseridas no teclado, selecionadas com o ponteiro do mouse, copiado, cortado e colado de e para o Prancheta, arrastar e cair dentro do mesmo ou outro editor Windows e pesquisas de texto realizadas. As janelas também podem ser cascaded, telhado ou minimizado. O usuário pode personalizar a exibição em Windows Windows selecionando a fonte, o tamanho da fonte e o comprimento da linha. UMA seqüência é analisada simplesmente trazendo uma janela do editor para o topo, e selecionando a análise necessária no menu. Todas as análises podem também ser realizado em uma região selecionada da sequência em um editor janela. Clicar com o botão direito do mouse irá fornecer um contexto-sensível menu popup. Isso dá ao usuário um atalho conveniente para a maioria dos menu Itens. DNA SSIST também fornece uma velocidade com botões representando ações comuns. As análises disponíveis em DN Ajuda Incluir: a conversão de uma sequência de DNA entre a circular e formas lineares a conversão do DNA para um RNA ou uma sequência de proteína a conversão do RNA para um DNA ou uma sequência de proteína traduzindo uma sequência de DNA para a sequência de aminoácidos em um, três ou todos os seis quadros Localizando quadros de leitura abertos (ORFS) em uma sequência de DNA Localizando padrões de sequência específicos em uma sequência (isso permite curingas, incompatibilidades e lacunas) Realizando uma análise de enzima de restrição com um conjunto definido de enzimas. Realizando uma análise do promotor de DNA com especificado fatores de transcrição Localizando fortes sinais de posicionamento nucleosome no DNA Realizando vários alinhamentos de DNA, RNA ou proteínas Obtendo o peso molecular de um ácido nucleico ou proteína Obtendo a temperatura de fusão de um oligonucleótido Calculando o PI de uma proteína Calculando o perfil hidrofílico, hidrofóbico ou antigênico de uma proteína. Obtendo o coeficiente de absorção molar e E0.1% de um ácido nucleico ou uma proteína Obtendo a composição de nucleotídeo ou aminoácido de um ácido nucleico ou proteína dn assistência traz todos estes Recursos em um Windows® bem integrado aplicativo. Isso dá ao usuário a liberdade de trabalhar no Ieae intuitivo do DN Assistência como em um processamento de texto ambiente, e ter uma bateria extensa e poderosa de Recursos analíticos Um clique do mouse de distância. O resultado de um A análise é exibida em uma janela de resultados e pode ser impressa, salva para o disco ou copiado e colado em aplicativos de terceiros. Salvo ou Os resultados copiados retêm o formato em que foram exibidos. O O usuário pode selecionar a partir de uma ampla gama de opções de formatação. Isto inclui a exibição de sequências como linhas contínuas de texto ou como blocos de texto. Um ou ambos os fios de uma sequência de DNA podem ser exibidos. A posição dos números de sequência em relação à sequência pode também ser especificado, conforme a face e o tamanho da fonte. O usuário também pode Especifique as cores das caixas usadas para indicar idênticas ou conservadas aminoácidos em vários alinhamentos. É assim possível personalizar DN Assistência à preferência de cada usuário. A tela Opções de formatação e as opções da janela do editor são salvas no Registro Quando o usuário sai DN auxiliar . Em um usuário múltiplo ambiente, essas configurações estão associadas ao nome sob o qual O usuário conectou no Windows®. Isso permite que muitos usuários usem DN Assistência em um único computador, onde cada usuário terá preferências personalizadas que não são alteradas por parte do outro Comercial.

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