Cartógrafo

Um programa para análise de ligação genética
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Cartógrafo Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • Russell L. Malmberg
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 472 KB

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Cartógrafo Descrição

O Mapmaker é um conjunto de aplicativos que podem ser usados para construir mapas de ligação genética e realizar mapeamento genético. Entregue dentro de um pacote leve, ele inclui duas ferramentas de linha de comando, nomeadamente mapmaker / exp e mapmaker / qtl. O primeiro vem com opções para gerar os principais grupos de ligação e analisar a saída para determinar os marcadores dominantes, co-dominantes e recessivos, enquanto este melhor ajuda os genes, fazendo uso dos mapas de ligação gerados anteriormente. O MapMaker / Exp trabalha com arquivos de texto ASCII planos que contêm o conjunto de dados derivados de vários tipos de cruzes (backcross, intercrus, testcross, dados haplóides). A outra aplicação funciona apenas com dados de intercrust e backcross f2. Você começa preparando o conjunto de dados para análise e carregá-lo no MapMaker / Exp. O aplicativo vem com uma ampla gama de comandos que você pode usar para listar, editar, nome ou apagar seqüências genéticas, inserir marcadores dentro de uma sequência. Você pode usá-lo para realizar análises em pares para pares de marcadores e realizar análise multiponto. Ele pode atribuir marcadores a um cromossomo e exibir o status de mapeamento de alguns loci. O programa possui recursos de detecção de erros de genotipagem e permite que você participe de HaplotyPes em um único conjunto de dados. Ele pode salvar os dados em um banco de dados e salvar o status e o mapeamento resulta para o seu computador. O Mapmaker / Qtl é usado para mapeamento genético, com vários comandos de traço e permitindo que você salve os dados obtidos no PostScript, compare os mapas QTL e assim por diante.


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