tmod. tmod é uma ótima aplicação que integra programas de descoberta de doze motivos.
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tmod. Classificação e resumo

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tmod. Descrição

Encontra motivos usando uma ampla variedade de programas de descoberta, como biopropector, motifsampler, glam, alignace, motifregressor, etc. Exibe as informações em uma interface de usuário gráfica. O TMOD é desenvolvido para os usuários dos sistemas operacionais Windows e possui uma interface gráfica de usuário fácil de usar (GUI). O TMOD integra programas de descoberta de doze motivos: Alignace (Roth et al., 1998), Bioprospector (Liu et al., 2001), consenso (Hertz e Stormo, 1999), Meme (Bailey e Elkan, 1994), Mdscan (Liu et al. ., 2002), Motifsampler (Thijs, et al., 2001; Thijs, et al., 2002), SESIMCMC (Fusov, et al., 2005), glam (Frith, et al., 2004), Motifregressor (Conlon, et al., 2003), YMF (Sinha e Tompa, 2003), Weeder (Pavesi, et al., 2001; Pavesi, et al., 2004; Pavesi, et al., 2004) e Gibbs Motif Sampler (Liu, et Al., 1995; Newberg, et al., 2007; Thompson, et al., 2004; Thompson, et al., 2003; Thompson, et al., 2007). O motivo encontrando algoritmos incluídos no TMOD tem sido amplamente citado e comprovou excelentes métodos no campo de pesquisa da descoberta do motivo. O TMOD é desenvolvido em C ++ com o suporte de MFC e Cygwin. e compilado na plataforma Windows e pode ser executado no sistema Windows 7 / Windows Vista / Windows XP / Windows 2000. O requisito mínimo de memória (RAM) do TMOD é de 256MB.

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