msatcommander.

Localizar repetições de microssatélite, projetar iniciadores específicos de locus e marque-os
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msatcommander. Classificação e resumo

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  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • faircloth
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 5.7 MB

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msatcommander. Descrição

O MSATCommander é um programa Python escrito para localizar microssatélite (SSR, VNTR, C) repete dentro de seqüência formatada por FASTA ou arquivos de consenso formatados. O MSATFinder procurará por todas as repetições di-, tetra, penta e hexa-nucleotídeo (com opções para procurar menos tipos de repetição e combinações de tipos de repetição). Dê a MsatCommander Tente avaliar totalmente suas capacidades! Principais características: Pesquisas por todas as repetidas mono, di-, tricact, penta e hexanucleotida As repetições podem ser combinadas entre as distâncias especificadas pelo usuário (BP) projeta primers para repetições localizadas Tags e iniciadores de testes com M13R, CAG ou Tag Personalizada. O primer 'melhor' é reportado ao usuário Adiciona pigtails de GTTT ao iniciador "melhor" de "melhor" relatado ao usuário oferece uma GUI conveniente para a maioria dos usuários As saídas resulta no formato CSV, para facilitar a importação para o software de planilha


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