mpsqed. editor de alinhamento e designer de ensaio de pirosequenciamento multiplex
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Os ensaios de diagnóstico baseados em moleculares são o padrão de ouro para doenças infecciosas hoje, uma vez que permitem uma identificação rápida e sensível e digitação de vários patógenos. Enquanto a PCR pode ser projetada para ser específica para um certo patógeno, uma análise subseqüente de seqüência é freqüentemente necessária para confirmação ou digitação. O desenho de ensaios baseados em PCR apropriados é uma tarefa complexa, especialmente quando os polimorfismos discriminantes conservados são raros ou se o número de tipos que precisam ser diferenciados é alto. Um método extremamente útil, mas subutilizado para este propósito é a técnica de pirosequenciamento multiplex. O MPSQED é uma aplicação baseada em Java direcionada para facilitar a criação de tais ensaios.

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