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jcompoundmapper. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Nome do editor:
  • Georg Hinselmann
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
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  • 10.7 MB

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jcompoundmapper. Descrição

O JComPoundMapper foi criado para fornecer algoritmos populares de impressões digitais para gráficos químicos. Entre esses gráficos, podemos encontrar as impressões digitais de busca de profundidade, impressões digitais a mais curtas, impressões digitais de conectividade estendida, impressões digitais de autocorrelação (por exemplo, impressões digitais radiais (por exemplo, molprint2d), moldes geométricas, pares de átomos e impressões digitais farmacófose. O JComPoundMapper fornece exportadores para vários formatos para ferramentas de aprendizado de máquina, como libsvm, liblinear e weka. O aplicativo permite uma parametrização como profundidade de pesquisa, corte de distância ou digitação do átomo. No caso de impressões digitais Hashed, você pode configurar o tamanho do espaço hash. JComPoundMapper para o cálculo de matrizes de similaridade para abordagens de agrupamento ou como formato de entrada para libsvm O software pode ser usado como uma biblioteca jar leve ou um executável independente O JComPoundMapper é baseado apenas no software de código aberto com uma licença liberal. Ele usa o sistema de especialistas químicos do kit de desenvolvimento de química. O principal objetivo do programa é: · Fornecer implementações de impressões digitais padrão para experimentos de mineração de dados · Implementações de código aberto com uma definição exata · Ferramenta de linha de comando fácil de usar para as tarefas descritas · Fornecer uma base para o desenvolvimento de novas codificações de impressões digitais que podem ser comparadas, por exemplo, para algoritmos com exatamente o mesmo algoritmo de rotulagem.


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